结论概述：当公司账户被冻结且其中包含其他人的资金时，首先需要明确冻结的原因，然后根据不同情况采取相应的法律措施来保护各方权益。以下是从多个角度对此问题的详细分析。
一、明确冻结原因
公司账户被冻结通常是由于涉及法律纠纷，如债务纠纷、合同违约、税务问题或涉嫌违法犯罪等。第一步应当是尽快与冻结机关（如法院、银行或相关执法部门）联系，了解冻结的具体原因和法律依据。
二、分析资金归属与冻结合法性
资金归属明确：
- 如果冻结的资金确实属于其他个人或实体，且这部分资金与公司自身的债务或法律纠纷无关，那么公司有权向冻结机关提出异议，要求解冻这部分资金。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，冻结财产应当限于争议标的的范围或者与本案有关的财物。如果冻结的资金超出争议范围，公司可以申请解除超额部分的冻结。
冻结合法性审查：
- 审查冻结程序是否合法，包括冻结机关是否具备冻结权限、冻结手续是否完备、是否依法送达了冻结通知书等。
- 如果冻结程序存在违法之处，公司可以向冻结机关提出书面异议，或者通过法律途径（如申请行政复议或提起行政诉讼）来维护自身权益。
三、采取法律措施保护权益
提出异议申请：
- 公司可以向冻结机关提交书面异议申请，说明冻结资金中属于其他人的部分，并提供相关证据（如资金来源证明、转账记录等）。
- 冻结机关在收到异议申请后，应当进行审查，并在法定期限内作出是否解除冻结的决定。
协商与调解：
- 在法律程序之外，公司也可以尝试与冻结申请人（如债权人）进行协商，寻求达成调解协议，以解冻部分或全部资金。
- 协商过程中，公司可以提出合理的还款计划或担保措施，以换取冻结申请人的同意解冻。
法律诉讼：
- 如果协商无果，且公司认为冻结行为侵犯了其合法权益，可以向法院提起诉讼，要求确认冻结行为违法并赔偿损失。
- 在诉讼过程中，公司需要提供充分的证据证明冻结资金的归属以及冻结行为的违法性。
四、预防措施与建议
完善公司财务管理制度：
- 公司应建立健全的财务管理制度，确保资金流动的透明度和合规性，避免将公司资金与个人资金混同使用。
定期进行法律风险评估：
- 公司应定期邀请专业律师进行法律风险评估，及时发现并解决潜在的法律问题，降低账户被冻结的风险。
建立应急响应机制：
- 公司应建立应对账户冻结等突发事件的应急响应机制，包括指定专人负责与冻结机关沟通、准备相关证据材料等，以快速有效地应对冻结事件。
总结与建议：面对公司账户被冻结且包含其他人资金的情况，公司应首先明确冻结原因，然后分析资金归属与冻结合法性，最后采取相应的法律措施来保护各方权益。同时，公司也应加强财务管理和法律风险防范意识，以预防类似事件的发生。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。