将五十年的混合用地改为商业用地是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：

一、合法变更的情形

1. 符合规划并履行法定程序：

   • 如果混合用地在土地利用总体规划和城乡规划中已经被明确规划为商业用地，或者可以通过合法的规划调整程序变更为商业用地，并且已经依法办理了土地用途变更手续，那么这种变更是合法的。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，土地用途的变更需要符合土地利用总体规划和城乡规划，并经过相关政府部门的批准。具体来说，可能需要经过自然资源主管部门的审批，并办理土地用途变更登记手续。

2. 集体经营性建设用地的流转：

   • 如果混合用地属于集体经营性建设用地，且在符合土地利用总体规划和城乡规划的前提下，已经依法登记，并经过本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或者三分之二以上村民代表的同意，那么可以通过出让、出租等方式交由单位或个人使用，包括用于商业用途。
   • 法律依据：同样依据《中华人民共和国土地管理法》第六十三条，集体经营性建设用地在符合一定条件下可以流转用于商业等经营性用途。

二、违法变更的情形

1. 未经批准擅自变更：

   • 如果混合用地未经相关政府部门的批准，擅自改变土地用途为商业用地，那么这种变更就是违法的。
   • 法律后果：根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，未经批准擅自改变土地用途的，可能会面临责令限期改正、没收违法所得、罚款等行政处罚。情节严重的，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。

2. 不符合规划或未履行集体决策程序：

   • 如果混合用地虽然符合土地利用总体规划，但不符合城乡规划，或者虽然属于集体经营性建设用地，但未经本集体经济组织成员的同意，擅自改变土地用途为商业用地，那么这种变更也是违法的。
   • 法律后果：同样可能面临行政处罚和刑事责任的风险。此外，如果因此造成了他人损失，还可能需要承担相应的民事责任。

三、实际操作中的注意事项

1. 了解土地规划和用途：

   • 在考虑将混合用地改为商业用地之前，应首先了解该土地在土地利用总体规划和城乡规划中的用途和限制条件。

2. 履行法定程序：

   • 如果符合规划并有意变更土地用途，应依法向相关政府部门提出申请，并履行必要的审批和登记手续。

3. 尊重集体决策：

   • 如果混合用地属于集体经营性建设用地，应确保变更土地用途的决定已经经过本集体经济组织成员的同意，并签订书面合同明确双方的权利和义务。

总结来说，将五十年的混合用地改为商业用地是否违法，取决于是否符合土地利用总体规划和城乡规划、是否履行了必要的法定程序以及是否尊重了集体决策。在做出变更决定之前，建议充分了解相关法律法规和政策要求，并咨询专业律师或相关政府部门的意见，以确保变更的合法性和安全性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。