挂靠公司的工程款账户能否被冻结，需分情况讨论，具体如下：

1. 若挂靠行为被认定为违法，且工程款涉及非法所得或债务纠纷
   根据《民法典》及相关司法解释，若挂靠行为违反法律强制性规定（如未取得建筑施工资质而挂靠），且工程款涉及非法所得（如虚开发票、偷逃税款等），或因挂靠产生的债务纠纷（如材料款、工人工资未支付），法院可根据债权人申请，冻结挂靠公司名下账户中的工程款。此时，冻结的合法性基于“债务归属”原则——即使工程款名义上属于挂靠公司，但若实际用于清偿挂靠人债务，法院可依法冻结。

2. 若挂靠行为合法（如符合行业特殊规定），且工程款权属清晰
   若挂靠行为符合特定行业规定（如某些地区允许具备资质的个体工商户挂靠），且工程款明确约定属于实际施工人（挂靠人），且无债务纠纷，则账户一般不应被冻结。但需注意：若挂靠公司自身存在其他债务纠纷（如借款、合同违约），债权人仍可能申请冻结其名下所有账户，包括存放工程款的账户。此时，挂靠人需通过“案外人异议之诉”主张工程款权属，要求解冻。

3. 实务中的关键点：证据与程序
   无论哪种情况，冻结账户均需满足法定程序（如法院出具冻结裁定书），且债权人需提供初步证据证明债务存在。若挂靠人认为冻结错误，可向法院提出异议，需提交证据证明工程款实际归属（如挂靠协议、资金流向证明等）。若证据充分，法院应解冻；若证据不足，冻结可能维持。

建议：若您涉及此类纠纷，需立即梳理挂靠协议、工程款支付记录等证据，评估冻结合法性，并考虑通过法律程序主张权利。具体操作可进一步向我咨询，我会结合您的证据和案件细节，提供针对性方案。