在离婚时处理老公自然人公司债务问题，需根据债务性质、用途及夫妻共同财产情况综合判断，具体处理方式如下：

1. 明确债务性质
   首先需区分债务是个人债务还是夫妻共同债务。根据《民法典》第1064条，若债务用于公司经营但未用于家庭共同生活（如未将公司收益用于家庭开支、未共同参与经营），且债权人无法证明该债务基于夫妻共同意思表示（如未签字确认或事后追认），则通常认定为个人债务，离婚时由负债方个人承担。
   例外情形：若债务虽以个人名义所借，但实际用于家庭共同生活（如公司盈利用于购房、子女教育等），或夫妻双方共同签字、事后追认，则可能被认定为共同债务，需共同偿还。

2. 举证责任分配
   若主张债务为个人债务，需由非负债方举证证明：

   • 债务未用于家庭共同生活（如公司账目与家庭财务独立、无大额资金转入家庭账户）；
     
   • 债权人明知债务为个人债务（如借款时明确约定为个人借款）。
     若主张债务为共同债务，则需由债权人或负债方举证证明债务用于家庭共同生活或基于共同意思表示。

3. 离婚协议或判决中的处理

   • 协议离婚：可在离婚协议中明确约定债务承担方式（如由负债方个人偿还），但需注意该约定仅对夫妻双方有效，不能对抗债权人。若债权人仍向双方主张权利，非负债方偿还后可依据离婚协议向负债方追偿。
     
   • 诉讼离婚：法院会根据债务性质、用途及夫妻共同财产情况判决债务承担方式。若认定为个人债务，由负债方偿还；若认定为共同债务，通常判决双方共同偿还，但会结合财产分割情况（如负债方分得更多财产）调整分担比例。

4. 公司债务与夫妻共同财产的隔离
   若公司为自然人独资企业，需注意《公司法》第63条规定的“法人人格否认”制度：若负债方无法证明公司财产独立于个人财产，债权人可能要求负债方以个人财产（包括夫妻共同财产中的负债方份额）偿还公司债务。此时，非负债方可主张分割夫妻共同财产时保留必要份额，或通过举证公司财产独立来避免承担连带责任。

建议行动步骤：

1. 收集债务相关证据（如借款合同、转账记录、公司账目等），明确债务用途；
   
2. 梳理家庭财务状况，证明债务是否用于共同生活；
   
3. 协商或诉讼时，强调债务性质及举证责任分配；
   
4. 若涉及公司财产混同，尽快通过审计等方式证明财产独立。
   

如有具体证据或案件细节，可进一步向我咨询，我会结合实际情况提供更精准的建议。