针对您提出的“单位申报人员已离职怎么处理”的问题，这是一个涉及税务和社会保险两方面的事务，下面我将为您详细解答：
一、税务处理方面
当单位有员工离职时，扣缴单位（即您所在的单位）需要及时在自然人电子税务局扣缴端更新该员工的相关信息。具体操作步骤如下：
登录自然人电子税务局扣缴端：使用单位的税务账号和密码登录系统。
进入人员信息采集功能：在系统中找到“人员信息采集”模块，这是管理员工税务信息的地方。
更新离职员工信息：
- 对于单个离职员工，您可以双击打开其信息，在“任职受雇从业信息”中填写“离职日期”，然后保存。
- 如果需要批量更新多个离职员工的信息，您可以勾选这些员工，点击“更多操作”中的“批量修改”，选择“离职日期”作为待修改属性，填写日期后点击“修改”。或者，您也可以导出人员信息表格，在表格中录入离职日期后再导入更新。
隐藏离职人员（可选）：如果您希望在人员信息采集页面中不再显示已离职的员工，可以点击“更多操作”中的“隐藏离职人员”。
二、社会保险处理方面
关于社会保险的处理，主要涉及到离职原因的申报和变更：
离职原因申报：单位在为员工办理社会保险减员时，需要申报离职原因。请确保申报的离职原因与实际情况相符。
离职原因变更：
- 如果单位申报的离职原因有误，需要由单位提供《情况说明》、《离职证明》、劳动合同原件等员工离职证明材料，前往当地社会保险事业管理中心（如南宁市社会保险事业管理中心）线下任一管理部填表办理社会保险离职原因变更事宜。
- 如果员工个人对单位申报的减员原因有异议，建议先与用人单位协商解决。如果单位不配合修改离职原因，员工个人可以通过申请劳动争议仲裁等法律途径，凭仲裁判决书等法律文书结果办理社会保险减员原因变更事宜。
总结与建议：
- 单位在员工离职后，应及时更新税务和社会保险系统中的员工信息，确保数据的准确性和合规性。
- 对于离职原因的申报和变更，单位应秉持诚实守信的原则，确保申报信息的真实性。
- 如果遇到问题或纠纷，建议及时与相关部门或专业人士沟通咨询，以维护双方的合法权益。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。