在男方起诉离婚的案件中，关于孩子抚养权的判决，法院会遵循一个核心原则，即确保未成年子女的最佳利益。这一原则贯穿于整个判决过程，并会综合考虑多种因素来做出最终决定。以下是对这一问题的详细解答：

一、总体原则与考虑因素

法院在判决孩子抚养权时，会全面审视父母双方的抚养能力、条件，以及孩子的年龄、健康状况、意愿（若达到一定年龄）等。这些因素共同构成了判决的基础，旨在确保孩子能在最有利于其健康成长的环境中生活。

二、不同年龄段孩子的抚养权判决规则

1. 不满两周岁的子女：

   • 原则：通常由母亲直接抚养，因为这一阶段的子女对母亲有强烈的生理和情感依赖。
   • 例外：若母亲存在严重疾病、不尽抚养义务或其他原因导致子女不宜随其生活，父亲可请求直接抚养。

2. 已满两周岁的子女：

   • 判决依据：法院会根据双方的具体情况，按照最有利于子女的原则进行判决。
   • 主要考虑因素：
     • 经济状况：稳定的收入和良好的经济条件能为孩子提供更好的生活、教育和医疗环境。
     • 居住条件：安全、适宜的住房环境以及周边配套设施对孩子的成长至关重要。
     • 陪伴时间与照料能力：一方若能提供更多陪伴和照顾，相比工作繁忙的一方，更有可能获得抚养权。
     • 教育背景和品德修养：父母的教育水平和教育理念，以及品德修养，都会对孩子产生深远影响。
     • 生活习惯和成长环境：维持孩子原有的稳定生活环境，避免改变带来的不利影响。
     • 祖父母或外祖父母的抚养意愿和能力：若孩子长期由祖父母或外祖父母照顾，且他们有能力并愿意继续协助照顾，这也会作为判决的参考。

3. 已满八周岁的子女：

   • 尊重意愿：法院会认真听取并尊重孩子的真实意愿，因为这一阶段的子女已经具备一定的认知和判断能力。

三、其他特殊情况

• 特殊健康需求：对于有特殊健康需求的子女，法院会特别考虑哪方更能提供必要的医疗和照顾。
• 家庭暴力、虐待、遗弃等恶劣行为：这些行为会严重影响子女的身心健康，法院在判决时会严肃考虑，并可能导致抚养权判给另一方。

四、司法实践中的操作与建议

• 调解与庭审：法院可能通过调解、庭审等多种方式全面了解双方情况和子女需求，以确保判决的公正性和合理性。
• 判决结果：可能的结果包括一方直接抚养、另一方支付抚养费，或在某些情况下判定双方共同抚养。
• 专业咨询：由于抚养权判决涉及多个复杂因素，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助，确保判决结果最有利于孩子的健康成长。

综上所述，男方起诉离婚后孩子抚养权的判决是一个复杂而细致的过程，需要法院综合考虑多种因素。在实际操作中，应坚持法律原则与人文关怀相结合，确保每个子女都能在最适合自己的环境中健康成长。