结论：是否合法取决于新入住者与原承租人之间的关系以及是否获得了您的同意。以下分情况详细说明：

1. 若新入住者是原承租人的同住人或家庭成员，且租赁合同中有相关约定或您事先知晓并同意：

   • 在这种情况下，新入住者的居住行为可能是合法的。因为原承租人可能基于家庭生活的需要，将房屋部分或全部转由其同住人或家庭成员居住，这通常被视为租赁合同履行的一种方式，只要不违反租赁合同的约定或法律法规的强制性规定。
   • 建议：您可以查看租赁合同中是否有关于同住人或家庭成员居住的相关条款，或者与原承租人沟通确认新入住者的身份和居住情况。

2. 若新入住者是原承租人未经您同意擅自转租的租客：

   • 在这种情况下，新入住者的居住行为可能是不合法的。因为根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，承租人未经出租人同意转租的，出租人可以解除合同。这意味着，如果原承租人未经您的同意将房屋转租给新入住者，您有权要求新入住者搬离，并可能追究原承租人的违约责任。
   • 法律依据：《中华人民共和国民法典》第七百一十六条规定：“承租人经出租人同意，可以将租赁物转租给第三人。承租人转租的，承租人与出租人之间的租赁合同继续有效；第三人造成租赁物损失的，承租人应当赔偿损失。承租人未经出租人同意转租的，出租人可以解除合同。”
   • 建议：您可以先与原承租人沟通，要求其立即停止转租行为并让新入住者搬离。如果沟通无果，您可以考虑通过法律途径解决，如向法院提起诉讼要求解除租赁合同并追究原承租人的违约责任。

3. 若新入住者是原承租人离开后，您与新入住者直接建立了新的租赁关系：

   • 在这种情况下，新入住者的居住行为是合法的。因为您已经与新入住者就房屋的租赁事宜达成了新的协议，并建立了新的租赁关系。
   • 建议：为了保障双方的权益，建议您与新入住者签订书面的租赁合同，明确双方的权利和义务，如租金、租期、维修责任等。

额外提醒：在处理此类房产租赁纠纷时，建议您先尝试与对方进行友好沟通，寻求和解的可能性。如果沟通无果或对方态度强硬，您可以考虑寻求法律帮助或通过法律途径解决纠纷。同时，为了保障自己的权益，建议您在租赁过程中保留好相关证据，如租赁合同、租金收据、沟通记录等。

如果您在处理此类纠纷时遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。