结论：红灯亮时骑摩托越过停止线，然后在路中间停下来，一般不算闯红灯，但可能会被认定为越线停车，属于不按规定行驶的违规行为。以下是对此问题的详细分析：
一、闯红灯的认定标准
在我国，电子眼拍摄闯红灯通常需要三张照片作为证据：
- 车辆驶过停止线；
- 车辆到达路中间；
- 车辆到达对面路口。
只有当这三张照片都齐备时，才会被认定为闯红灯。这一标准确保了闯红灯行为的准确识别，避免了误判。
二、具体情形分析
不算闯红灯的情况：
- 如果红灯亮起时，车辆只是刚刚越过停止线就立即停下，虽然车身一部分处于路中间，但并没有继续行驶通过路口，这种情况通常不会被认定为闯红灯。因为车辆没有构成完整的闯红灯过程，即没有同时满足上述三张照片的抓拍条件。
可能算越线停车的情况：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第五十一条的规定，机动车遇到停止信号时，应依次停在停止线以外；没有停止线的，应停在路口以外。因此，如果车辆越过停止线后停车，未继续行驶，则被视为越线停车，这是一种违规行为。
三、越线停车的法律后果
- 依据《中华人民共和国道路交通安全法》及各地实施办法，越线停车一般会处以罚款，有些地区还会扣2分。具体处罚标准可能因地区而异，但通常都会包含罚款和扣分两项。
四、特殊情况考虑
- 如果车辆因前方有障碍物、交通事故或其他紧急情况而被迫越过停止线后停车，且驾驶员能及时采取必要措施保障道路安全，通常不会被视为违规。但这种情况需要驾驶员提供充分的证据来证明其停车的合理性。
五、建议与提醒
- 为了避免不必要的麻烦和处罚，建议驾驶者在行车过程中严格遵守交通规则，遇到红灯时应及时停车等待绿灯再行通过。
- 如果不慎误闯红灯或越线停车，也应立即停车并采取必要措施确保交通安全。同时，可以保留相关证据（如行车记录仪视频等），以便在收到违章通知时进行申诉。
- 如有任何疑问或争议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。
综上所述，红灯亮时骑摩托越过停止线并在路中间停下，一般不算闯红灯，但可能构成越线停车的违规行为。驾驶者应时刻保持警惕，严格遵守交通规则，以确保自身和他人的安全。