关于公司法人变更时原法人的股份如何处理的问题，这是一个涉及公司治理结构和股权变动的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、法人变更与股权变动的关系
首先，需要明确的是，公司法定代表人的变更并不直接导致公司股权结构的变动。法定代表人是代表公司行使职权的负责人，其变更属于公司治理结构层面的调整。只要股东未进行股权转让、未被公司依法回购股权，或未出现其他导致股权丧失的法定情形，其股权依然存在并受法律保护。
二、原股权的处理方式
股权不变：
- 在公司更换法定代表人时，原股东可以选择继续持有其股权，不进行任何股权变动。此时，公司的股权结构保持稳定，原股东按照其原有的股权比例继续享有股东权利，如分红权、表决权等，并承担股东义务，如出资义务、遵守公司章程等。
股权变更：
- 如果原股东因个人资金需求、战略调整或公司重组、合并、分立等重大事项发生时，可能选择进行股权转让、股权回购、股权继承或赠与等股权变更操作。这些变更需要遵循相关法律法规和公司章程的规定，并办理相应的股权变更登记手续，以确保股权变动的合法性和有效性。
三、遵循法定程序与注意事项
明确股权归属：
- 在处理原股权时，应首先明确股权的归属。股东的股权是基于其对公司的出资或受让等合法方式取得的，公司更换法定代表人并不影响原股东的股权享有。
召开股东会与准备材料：
- 就法定代表人变更事宜，公司应召开股东会进行讨论和决议，形成股东会决议。同时，需要准备包括变更申请书、股东会决议、章程修正案等在内的相关变更材料，以备向工商行政管理部门提交。
办理工商变更登记：
- 将准备好的材料提交给工商行政管理部门，申请变更法定代表人。工商部门会对提交的材料进行审核，如无问题则予以变更登记，并颁发新的营业执照。此时，公司的法定代表人变更即完成。
后续事宜处理：
- 变更法定代表人后，公司应尽快到银行办理对公账户的更迭事宜，并同步修正与替换所有涉及原法定代表人姓名的公司证件，如税务登记证、组织机构代码证等，以确保公司整体运行顺畅及法律合规。
- 如果法人变更伴随公司重大事项，如股权结构调整、公司合并分立等，原股东应根据公司的具体情况、相关法律规定以及公司章程来确定是否需要变更股权，并办理相应的手续。
税务处理：
- 法人变更后，公司可能还需要到税务部门办理相应的税务变更手续，如变更税务登记证等。如果涉及股权转让，转让方可能需要按照税法规定缴纳个人所得税或企业所得税。因此，在进行股权变更时，应充分考虑税务因素，并咨询专业税务顾问的意见。
四、总结与建议
综上所述，公司更换法定代表人时原股权的处理应关注股权的归属和法定程序的遵循。在整个过程中，应确保所有操作的合法合规性，并根据实际情况及时办理相关税务手续。同时，原股东应根据公司具体情况和法律规定决定是否进行股权调整，以维护自身合法权益并确保公司整体运行的稳定性和合法性。如果您在处理此类问题时遇到任何疑问或困难，建议咨询专业律师或相关机构的意见。