手写协议就一份，在符合法定条件的情况下，仍然是有效的。不过，其有效性并非仅由“手写”和“仅有一份”这两个因素决定，而是需要综合考虑多个方面。以下是对此问题的详细分析：
有效的情况
内容合法合规：
- 协议内容必须严格遵守法律法规的强制性规定，不得涉及任何违法活动或违背公序良俗的内容。例如，关于房屋租赁、商品买卖等合法事务的约定，只要条款合理且符合法律要求，即构成有效的协议内容。
双方自愿签订：
- 协议的签订必须是基于双方的真实意愿，不存在欺诈、胁迫、重大误解等不正当手段。这确保了协议是双方平等协商、自愿达成的结果，从而保障了其有效性。
具备民事行为能力：
- 签订协议的双方当事人都必须具有相应的民事行为能力。对于成年人而言，除非存在精神异常等情况，否则一般均视为具备行为能力。对于未成年人或精神病人，则需由其法定代理人代为签订或经法定程序确认其行为能力。
形式符合要求（尽管手写，但满足基本书面形式）：
- 手写协议本身是一种有效的书面形式。虽然某些特定类型的协议可能要求采用更为严格的书面形式（如需要公证或见证），但手写协议在满足基本书面形式要求的前提下，同样具备法律效力。
需要注意的情况（可能影响有效性）
仅有一份协议的风险：
- 尽管手写协议的有效性不依赖于其份数，但仅有一份协议可能增加纠纷的风险。例如，如果协议丢失或损毁，可能难以证明协议的内容和双方的权利义务。因此，建议双方各保留一份协议原件，或至少保留协议的复印件或照片等证据。
特定类型协议的形式要求：
- 对于某些特定类型的协议（如房屋买卖合同、建设工程合同等），法律可能规定需要采用特定的形式才能生效。如果手写协议未满足这些法定形式要求，可能会影响其效力。因此，在签订这类协议时，应特别注意法律对形式的要求。
建议与注意事项
- 确保协议内容清晰明了：手写协议应明确约定主要条款，包括当事人信息、标的、数量、质量、价款或报酬、履行期限、地点和方式等。关键条款的缺失或约定不明可能导致纠纷，并影响协议的实际履行和效力认定。
- 保存好协议原件：为了避免协议丢失或损毁带来的风险，建议双方妥善保管协议原件。如果可能的话，可以制作多份副本并分别保管。
- 咨询专业律师（此处指在复杂情况下）：虽然手写协议在法律上是被认可的，但在签订涉及重大利益或复杂法律关系的协议时，建议咨询专业律师的意见。律师可以提供专业的法律建议，帮助双方完善协议条款并降低法律风险。不过，在一般情况下，你已经可以直接向我咨询相关法律问题，我会为你提供专业的解答。
综上所述，手写协议就一份在符合法定条件的情况下仍然是有效的。但为了确保协议的法律效力和减少纠纷风险，建议双方在签订时注意上述事项，并在必要时咨询专业律师的意见。