核心结论：回迁协议上写了两个名字但仅有一个人的身份证号，这种情况可能会影响协议的效力及后续权利义务的履行，需根据具体情况采取相应措施进行完善或补救。以下是具体分析：

1. 协议效力问题
   回迁协议作为民事合同，其有效性依赖于主体身份的明确性。若协议中仅列明两人姓名但未完整填写两人的身份证号，可能因主体信息不完整导致协议存在瑕疵。根据《民法典》第143条，民事法律行为有效的条件包括“行为人具有相应的民事行为能力”及“意思表示真实”，而身份信息的缺失可能影响对行为人身份的认定，进而引发对协议效力的争议。

2. 权利义务归属风险
   身份证号是确定自然人身份的法定依据。若协议中仅一人身份证号明确，另一人身份无法通过协议内容直接确认，可能导致：

   • 在办理回迁房产权登记时，房管部门可能要求补充完整身份信息，否则拒绝办理；
     
   • 若发生纠纷（如回迁面积分配、补偿款领取等），未明确身份证号的一方可能因主体资格存疑而难以主张权利；
     
   • 若协议涉及共有财产（如回迁房为两人共有），身份信息缺失可能影响共有份额的认定。

3. 补救措施建议

   • 协商补充：立即与协议相对方（如开发商、拆迁方）联系，要求补充另一人的身份证号，并签署补充协议或对原协议进行修正；
     
   • 公证确认：若无法直接补充协议，可由未填写身份证号的一方出具书面声明（附身份证复印件），并经公证机构公证，以证明其协议主体身份；
     
   • 法律程序：若协议已部分履行且产生争议，可向法院提起确认之诉，请求法院认定协议效力及双方权利义务，此时需提供其他证据（如拆迁公告、选房记录等）佐证身份。

4. 预防性建议
   未来签署类似协议时，务必确保所有主体信息（姓名、身份证号、联系方式等）完整、准确，并由各方签字捺印确认。若涉及多人共有，可明确约定共有方式（按份共有/共同共有）及份额，避免后续纠纷。

行动提示：若您已因此问题遇到实际困难（如无法办理产权证、对方拒绝补充信息等），建议携带协议原件及相关材料，进一步向我详细说明情况，以便制定具体解决方案。