您好，关于您提到的“需要网签但在网上操作了纸质协议书签约登记是否有影响”的问题，我可以为您详细解答。
首先，我们要明确的是，网签和纸质协议书签约登记在本质上都是合同或协议的签署方式。在现代电子政务和电子商务的推动下，网签（即电子签约）已经越来越普及，并且得到了法律的认可和保护。
网签的合法性：
根据《中华人民共和国电子签名法》第三条，民事活动中的合同或其他文件，当事人可以约定使用电子签名、数据电文。只要当事人约定使用，且符合相关法律规定，电子签名的文书就不得仅因为其采用电子形式而被否定法律效力。
《国务院关于在线政务服务的若干规定》第十条也明确指出，电子证照与纸质证照具有同等法律效力。这意味着，在政务服务领域，电子签约和纸质签约在法律上是等效的。
网上操作纸质协议书签约登记的影响：
如果您在网上操作了纸质协议书的签约登记，这实际上可能是一种混合签约方式。即，您可能先在网上填写了协议内容，然后打印出来签字，或者通过电子方式签署了协议的电子版，并同时保留了纸质版。
从法律角度来看，只要您的签约过程符合相关法律规定，无论是纯电子签约还是混合签约，都不会影响协议的法律效力。关键在于确保签约过程的真实性、完整性和不可篡改性。
然而，需要注意的是，如果某些特定场景或行业对签约方式有特殊要求（如必须使用纸质签约或必须通过特定平台进行网签），那么您需要遵循这些要求。但在大多数情况下，网签和纸质签约都是被接受的。
建议：
在进行签约前，最好先了解相关场景或行业对签约方式的具体要求。
如果选择网签，请确保使用可靠的电子签名平台，并遵循相关法律规定进行操作。
无论选择哪种签约方式，都请保留好签约证据（如电子签名记录、纸质协议书等），以备不时之需。
综上所述，网上操作纸质协议书签约登记本身并不会影响协议的法律效力，但关键在于确保签约过程的合法性和合规性。如果您有任何进一步的问题或疑虑，请随时咨询相关法律专业人士或机构。