在刑事诉讼中，当案件在审查起诉阶段发生管辖改变时，审查起诉期限的计算是一个重要且需要细致处理的问题。以下是对这一问题的详细解答：
一、基本原则
当案件审查起诉阶段发生管辖改变，无论是由于何种原因（如地域管辖、级别管辖的调整等），新的受理案件的人民检察院都需要从收到案件之日起，重新计算审查起诉期限。这一原则确保了新接手案件的人民检察院有足够的时间对案件进行全面、细致的审查。
二、具体期限规定
一般案件：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十二条的规定，人民检察院对于监察机关、公安机关移送起诉的案件，应当在一个月以内作出决定。这包括提起公诉或根据案件情况作出其他相应处理，如不起诉决定等。
重大、复杂案件：
- 对于重大、复杂的案件，人民检察院可以依法延长审查起诉期限十五日。这一延长是为了确保案件得到充分的审查和评估，避免因时间紧迫而导致的审查不周或遗漏重要证据。
认罪认罚且符合速裁程序案件：
- 如果犯罪嫌疑人认罪认罚，且案件符合速裁程序的适用条件，审查起诉的期限会有特别规定。通常情况下，人民检察院应当在十日以内作出决定。但如果可能判处的有期徒刑超过一年，可以延长至十五日。这一规定旨在提高诉讼效率，同时保障犯罪嫌疑人的合法权益。
三、实际操作中的注意事项
管辖改变的通知与接收：
- 当案件需要改变管辖时，原受理案件的人民检察院应当及时通知有管辖权的人民检察院，并移送相关案卷材料。新受理案件的人民检察院在收到案件后，应立即开始重新计算审查起诉期限。
重新审查的全面性：
- 新受理案件的人民检察院在重新计算审查起诉期限后，应对案件进行全面、细致的审查。这包括重新熟悉案件情况、进行必要的调查核实、听取犯罪嫌疑人、被害人等诉讼参与人的意见等。
期限的严格遵守：
- 新受理案件的人民检察院必须严格遵守重新计算的审查起诉期限，不得无故延长或缩短。如因特殊情况需要延长审查起诉期限的，应依法办理延长手续，并通知相关诉讼参与人。
四、法律意义与目的
重新计算审查起诉期限的规定，旨在确保受移送的人民检察院有足够的时间对案件进行全面、细致的审查，从而保障审查起诉工作的质量和效率。同时，这一规定也体现了刑事诉讼程序的严谨性和公正性，确保了每个案件都能得到充分的审查和公正的处理，维护了诉讼参与人的合法权益。
综上所述，当案件在审查起诉阶段发生管辖改变时，新的受理案件的人民检察院应从收到案件之日起重新计算审查起诉期限，并依据相关法律规定进行确定和遵守。