结论：分公司负责人由借资质投标人担任通常不合适，这一安排可能涉及多重法律风险与合规问题，需谨慎评估并避免。以下从不同角度详细分析：
一、法律合规性角度
资质借用行为的违法性
根据《中华人民共和国招标投标法》第五十四条，投标人以他人名义投标或以其他方式弄虚作假骗取中标的，中标无效，处中标项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款，对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员处单位罚款数额百分之五以上百分之十以下的罚款；有违法所得的，并处没收违法所得；情节严重的，取消其一年至三年内参加依法必须进行招标的项目的投标资格并予以公告，直至由工商行政管理机关吊销营业执照。
若分公司负责人本身是借资质投标的实际操作者，其身份可能直接关联违法行为，担任负责人会加剧法律风险，甚至导致分公司被牵连处罚。
分公司负责人的法定职责
分公司虽不具有独立法人资格，但负责人需代表公司对外签署合同、管理业务，其行为后果由总公司承担。若负责人存在资质借用等违法行为，总公司可能因“表见代理”或管理失职承担连带责任，例如合同无效、行政处罚或民事赔偿。
二、公司治理与风险控制角度
内部管理混乱风险
借资质投标通常涉及伪造文件、虚构业绩等不诚信行为，若分公司负责人参与其中，可能破坏公司合规文化，引发员工效仿，导致内部管理失控。例如，其他部门可能为完成业绩指标模仿类似操作，最终引发系统性风险。
对外责任承担风险
分公司负责人以公司名义对外活动时，其行为可能被认定为职务行为。若因资质借用导致合同纠纷（如工程质量问题、付款纠纷），对方可能直接起诉分公司及总公司，要求承担违约责任或侵权责任，严重影响公司商誉及资金安全。
三、行业监管与信用评价角度
行业准入限制
部分行业（如建筑、医疗）对分公司负责人有明确的资质要求（如执业资格、从业年限）。借资质投标人往往不具备相应条件，若强行担任负责人，可能因“人证不符”被监管部门查处，导致分公司被暂停业务、降低资质等级或列入黑名单。
信用评价受损
资质借用行为可能被记录在企业信用档案中，影响公司参与政府采购、招投标等活动的资格。例如，根据《企业信息公示暂行条例》，行政处罚信息需通过国家企业信用信息公示系统向社会公示，长期存在将降低公司市场竞争力。
四、实务建议
立即终止资质借用行为
若分公司已存在此类操作，应立即停止并整改，避免风险扩大。例如，重新以合法资质参与投标，或与原合作方协商解除违法合同。
严格筛选分公司负责人
选择具备合法资质、良好职业操守的人员担任负责人，并建立背景调查机制（如核查学历、执业证书、过往工作经历），确保其符合行业监管要求。
完善内部合规制度
制定《招投标合规指引》《分公司负责人管理规范》等文件，明确禁止资质借用、虚假投标等行为，并定期开展合规培训，强化员工法律意识。
咨询专业律师进行风险评估
若涉及复杂交易结构或跨区域经营，建议委托律师对分公司负责人任命、招投标流程进行合规审查，提前识别潜在风险点。
总结：分公司负责人由借资质投标人担任，不仅违反《招标投标法》等法律法规，还可能引发公司治理、行业监管及信用评价等多重风险。建议企业严格遵守法律规定，通过合法途径参与市场竞争，避免因短期利益损害长期发展。如有进一步疑问，可直接向我咨询公司法务相关问题。