结论：网约车发生事故导致车辆大修，是否需要赔偿公司费用，这主要取决于事故责任归属、网约车与公司的合同约定以及是否存在保险理赔等因素。以下从不同角度进行详细分析：
事故责任归属：
- 如果事故是由网约车司机的过错导致的，比如违反交通规则、操作不当等，那么根据一般的法律原则，司机应当承担相应的赔偿责任。这种赔偿责任可能包括车辆维修费用、停运损失等。
- 如果事故是由第三方造成的，比如其他车辆碰撞导致网约车受损，那么赔偿责任应由第三方承担。在这种情况下，网约车司机或公司可以向第三方追偿。
网约车与公司的合同约定：
- 网约车司机与公司之间通常会有合同约定，明确双方的权利和义务。合同中可能会规定，在发生事故时，司机需要承担多少比例的维修费用，或者公司是否会提供一定的保险保障。
- 因此，要确定是否需要赔偿公司费用，首先需要查看合同中的相关条款。如果合同中有明确规定，那么应按照合同约定执行。
保险理赔情况：
- 网约车通常都会购买车辆保险，包括交强险和商业险。在发生事故时，保险公司会根据保险条款进行理赔。
- 如果保险理赔能够覆盖车辆维修费用，那么司机可能就不需要额外赔偿公司费用。但是，如果保险理赔不足或者存在免赔额等情况，那么司机可能需要根据事故责任和合同约定来承担剩余费用。
法律建议：
- 在发生事故后，网约车司机应首先确保人员安全，并及时报警和联系保险公司。
- 同时，司机应尽快与公司取得联系，报告事故情况，并了解公司的处理流程和要求。
- 根据事故责任、合同约定和保险理赔情况，司机应与公司协商确定是否需要赔偿公司费用以及赔偿的具体金额。
- 如果双方无法达成一致意见，或者存在争议，司机可以寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果司机需要赔偿公司费用但拒绝支付，公司可能会采取法律手段追偿，包括起诉司机或申请强制执行等。
- 这不仅会影响司机的个人信用记录，还可能给司机带来额外的经济负担和法律风险。
因此，网约车发生事故导致车辆大修时，是否需要赔偿公司费用需根据具体情况来判断。司机应积极与公司沟通协商，并根据事故责任、合同约定和保险理赔情况来妥善处理此事。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。