结论：同一法人注册的两个公司，其中一个公司被对方保全，另一个公司不一定会受影响，具体是否受影响需根据两个公司之间的法律关系、财产独立性以及保全的具体情况来判断。以下从不同角度进行分析：
一、公司财产独立性角度
财产独立：如果两个公司之间财产独立，即一个公司的财产并不属于另一个公司，且没有混同使用的情况，那么一个公司被保全通常不会直接影响另一个公司的财产。保全措施是针对特定公司的财产进行的，不会自动扩展到其他公司。
财产混同：如果两个公司之间存在财产混同，比如资金、资产等相互使用、无法区分，那么一个公司被保全可能会间接影响另一个公司。因为保全方可能会主张两个公司实际上是一个经济实体，从而要求对另一个公司的财产也采取保全措施。
二、法律关系角度
无直接法律关系：如果两个公司之间没有直接的债权债务关系或其他法律关系，那么一个公司被保全通常不会对另一个公司产生直接影响。保全措施是针对特定法律关系中的债务人或相关财产进行的。
存在法律关系：如果两个公司之间存在某种法律关系，比如担保关系、连带责任关系等，那么一个公司被保全可能会触发对另一个公司的法律责任。例如，如果一个公司为另一个公司的债务提供了担保，那么当被担保的公司被保全时，担保公司可能会面临被追偿的风险。
三、保全措施的具体情况
保全范围：保全措施的具体范围也会影响另一个公司是否受影响。如果保全措施仅针对特定财产或账户，且这些财产或账户与另一个公司无关，那么另一个公司通常不会受影响。
保全目的：保全措施的目的也是考虑因素之一。如果保全措施是为了防止债务人转移财产或逃避债务，且另一个公司并未涉及相关行为，那么另一个公司通常不会受影响。然而，如果保全方认为另一个公司也涉及相关行为或存在协助逃避债务的可能，那么可能会对另一个公司也采取保全措施。
四、建议与措施
审查公司财产与法律关系：建议两个公司分别审查自身的财产状况和法律关系，确保财产独立且无法律纠纷，以降低被牵连的风险。
积极应对保全措施：如果一个公司被保全，另一个公司应积极了解保全的具体情况，包括保全范围、目的等，并评估自身是否可能受影响。如有必要，可以寻求法律帮助，通过合法途径维护自身权益。
加强法律风险防范：两个公司应加强法律风险防范意识，建立健全的法律风险防控机制，避免涉及不必要的法律纠纷和保全措施。
总结：同一法人注册的两个公司，其中一个公司被对方保全，另一个公司是否受影响需根据具体情况判断。建议两个公司分别审查自身财产与法律关系，积极应对保全措施，并加强法律风险防范。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。