农村宅基地合作建房协议本身不能直接赋予永久居住权，能否实现“永久居住”需结合协议具体条款、宅基地使用权归属及法律规定综合判断。以下从不同角度展开分析：

1. 宅基地使用权的法律属性是核心限制

根据《土地管理法》第六十二条，宅基地使用权具有身份性和福利性，仅限本集体经济组织成员享有，且一户只能拥有一处宅基地。合作建房协议若涉及宅基地使用权流转（如非本集体成员参与建房），可能因违反法律强制性规定被认定无效，导致“永久居住”承诺失去法律基础。

例外情形：若合作方均为本集体成员，且协议仅约定共同建房、共享使用权（未突破“一户一宅”原则），则居住权可随宅基地使用权存续而延续，但“永久”表述仍需谨慎——宅基地使用权可能因征收、继承等法定事由终止。

2. 协议条款设计是关键

若希望通过协议实现长期居住保障，需明确以下条款：

• 居住权登记：根据《民法典》第三百六十八条，居住权需通过书面合同设立并办理登记。若协议未办理居住权登记，仅约定“永久居住”可能无法对抗第三人（如宅基地使用权人将房屋出售或抵押）。
• 权利义务边界：需约定居住权人的维护义务（如房屋修缮、税费缴纳）、使用权终止条件（如居住权人死亡、宅基地被征收）及补偿机制，避免因条款模糊引发纠纷。
• 集体经济组织同意：若合作方涉及非本集体成员，需取得集体经济组织书面同意，否则协议可能因“擅自处分宅基地”被认定无效。

3. 实践中的风险点

• 政策变动风险：宅基地制度改革试点地区（如浙江德清、四川泸县）可能允许宅基地使用权流转，但需以当地政策为准。若协议签订后政策调整，可能影响居住权实现。
• 继承问题：若居住权人非宅基地使用权人，其死亡后居住权是否可由继承人继承？根据《民法典》第三百六十九条，居住权原则上不得继承，但协议可另行约定（需符合公序良俗）。
• 征收补偿分配：若宅基地被征收，居住权人是否有权获得补偿？需在协议中明确补偿分配规则，否则可能因利益冲突导致诉讼。

建议

1. 优先办理居住权登记：若符合条件，及时到不动产登记机构办理居住权登记，确保权利公示公信。
2. 明确协议终止条件：避免使用“永久”等绝对化表述，改为约定“至宅基地使用权终止之日止”或“至双方协商一致之日止”。
3. 咨询当地主管部门：宅基地政策具有地域性，建议向当地农业农村局、自然资源局确认合作建房的合法性及登记流程。

若有具体协议条款或场景需要分析，可直接向我提供细节，我会结合法律和实务经验为您进一步解答。