结论前置：补充协议改变原合同条款的，原合同条款并非自始无效，而是根据具体情况，原合同中被改变的条款在补充协议生效后失去效力，但原合同中未被改变且不违反法律规定的条款仍然有效。
详细分析：
补充协议的法律效力基础：
- 补充协议是双方当事人在原合同基础上，通过协商一致对原合同内容进行补充、修改或废除部分条款而达成的协议。根据《中华人民共和国民法典》第五百四十三条，当事人协商一致，可以变更合同。因此，补充协议具有法律效力，能够对原合同条款产生变更或废除的效果。
原合同条款的效力变化：
- 当补充协议明确废除或修改原合同的某些条款时，这些被废除或修改的条款在补充协议生效后即失去效力。但这并不意味着原合同的所有条款都自始无效，而是仅限于被补充协议明确废除或修改的部分。
- 原合同中未被补充协议废除或修改，且不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗的条款，仍然具有法律效力，对双方当事人具有约束力。
具体情形分析：
- 补充协议合法有效：若补充协议是双方真实意思表示，内容合法合规，且遵循了法定程序（如有要求），则补充协议有效，能够废除或修改原合同的相应条款。此时，原合同中被废除或修改的条款在补充协议生效后失去效力，但原合同的其他条款仍然有效。
- 补充协议存在无效情形：若补充协议存在欺诈、胁迫、违反法律强制性规定或损害国家、集体、第三人利益等情形，则补充协议无效。此时，原合同中被补充协议试图废除或修改的条款仍然有效，因为补充协议的无效不影响原合同的效力。
实例说明：
- 假设甲公司与乙公司签订了一份货物买卖合同，约定了货物的价格、数量、交货时间等条款。后来，由于市场原材料价格波动，双方经协商一致签订了一份补充协议，调整了货物的价格。在此情况下，原合同中关于货物价格的条款被补充协议废除，失去效力；但原合同中关于货物数量、交货时间等未被补充协议修改的条款仍然有效。
法律建议：
- 在签订补充协议时，双方应明确约定废除或修改原合同的哪些条款，并确保补充协议的内容合法合规，遵循法定程序（如有要求）。
- 双方应仔细审查补充协议的内容，确保没有遗漏或误解原合同的条款，以避免后续争议。
- 若对补充协议的效力或原合同条款的效力存在疑问，建议及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见和指导。
总结：补充协议改变原合同条款的，原合同条款并非自始无效，而是根据补充协议的具体内容来确定哪些条款失去效力。在签订补充协议时，双方应谨慎审查，确保协议内容合法有效，以避免可能的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。