在银行卡转账借款纠纷中，管辖法院的确定主要依据被告住所地或合同履行地法院管辖原则，具体分析如下：

1. 被告住所地法院管辖
   根据《民事诉讼法》第二十二条，对公民提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖；被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。在银行卡转账借款纠纷中，若借款人（被告）的户籍地与实际居住地一致，则由户籍地法院管辖；若不一致（如借款人长期居住在外地），则需提供其经常居住地证明（如居住证、社区证明等），由经常居住地法院管辖。

2. 合同履行地法院管辖
   根据《民事诉讼法》第二十四条及《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》第三条，借贷双方未约定合同履行地的，以接受货币一方所在地为合同履行地。在借款纠纷中：

   • 出借人起诉借款人还款：出借人为接受货币一方，其住所地（或经常居住地）为合同履行地，出借人可选择向自身住所地法院起诉；
     
   • 借款人起诉出借人履行出借义务：借款人为接受货币一方，其住所地为合同履行地，借款人需向自身住所地法院起诉。
     需注意：若双方在借款合同中明确约定了履行地（如“借款发放地”“还款地”等），则以约定为准，不再适用“接受货币一方所在地”规则。

3. 特殊情形：协议管辖
   若双方在借款合同中通过书面协议（如补充协议、借条备注等）明确约定了管辖法院（如“发生争议由A法院管辖”），且该约定不违反级别管辖和专属管辖规定，则以协议约定为准。但需注意：

   • 协议管辖需采用书面形式（口头约定无效）；
     
   • 约定法院需与争议有实际联系（如一方住所地、合同签订地等）；
     
   • 不得违反《民事诉讼法》对级别管辖（如基层法院管辖一审普通案件）和专属管辖（如不动产纠纷由不动产所在地法院管辖）的规定。

实务建议：

• 若出借人欲主动起诉，可优先选择自身住所地法院（需确保未约定其他履行地或管辖法院），以降低诉讼成本；
  
• 若借款人户籍地与经常居住地不一致，出借人需提前调查其经常居住地证据（如租房合同、物业证明等）；
  
• 签订借款合同时，建议明确约定管辖法院（如出借人住所地法院），以避免后续管辖争议。
  

如有进一步疑问（如具体证据准备、管辖异议程序等），可直接向我咨询。