核心结论：二次逾期之前还的本金，在大多数情况下，是会被计入已还款项的，但具体是否算作有效还款，还需根据借款合同的具体条款以及还款时的实际情况来判断。以下从几个角度进行详细分析：
借款合同条款：
- 首先，要仔细审查借款合同中关于还款的条款。合同中通常会明确规定还款的时间、方式以及逾期还款的后果。如果合同中明确规定了即使发生逾期，之前已还的本金仍然有效，那么这部分本金自然会被计入已还款项。
- 如果合同中没有明确规定，或者规定较为模糊，那么就需要根据相关法律法规以及行业惯例来进行判断。
还款时的实际情况：
- 还款时，借款人应确保还款资金能够及时、准确地到达贷款人指定的账户。如果还款资金因各种原因（如银行转账延迟、账户信息错误等）未能及时到账，导致贷款人认为借款人未按时还款，进而产生逾期，那么借款人可能需要提供还款凭证来证明自己已经履行了还款义务。
- 在这种情况下，如果借款人能够提供充分的证据证明自己在逾期前已经还了部分本金，那么这部分本金通常会被认定为有效还款。
法律法规及行业惯例：
- 根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，借款人应当按照约定的期限返还借款。如果借款人未按照约定的期限返还借款的，应当按照约定或者国家有关规定支付逾期利息。但这并不意味着之前已还的本金会被视为无效。
- 在行业惯例中，通常也会认为即使发生逾期，之前已还的本金仍然有效，除非合同中有特别约定。
特殊情况下的处理：
- 如果借款人在逾期后与贷款人达成了新的还款协议，或者对之前的还款计划进行了调整，那么新的协议或调整后的计划可能会对之前已还的本金的认定产生影响。
- 另外，如果借款人因特殊原因（如重大疾病、自然灾害等）导致无法按时还款，并且能够提供充分的证据证明这一点，那么贷款人可能会考虑给予一定的宽限期或减免部分逾期利息，但这并不影响之前已还的本金的认定。
法律建议：
- 如果您面临二次逾期的情况，并且担心之前还的本金是否会被计入已还款项，建议您首先仔细审查借款合同中的相关条款。
- 如果合同中没有明确规定或者规定较为模糊，您可以尝试与贷款人进行沟通协商，提供还款凭证等证据来证明自己已经履行了部分还款义务。
- 如果沟通协商无果，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师（比如我，贾卫龙律师，专注于刑事辩护、债权债务领域），以便更好地维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果之前还的本金被认定为有效还款，那么您在后续还款时只需要偿还剩余的本金和利息即可。
- 如果之前还的本金被认定为无效还款（这种情况较为少见，通常需要合同中有特别约定），那么您可能需要重新计算并偿还全部的本金和利息，这可能会增加您的还款压力。因此，在还款前务必仔细审查合同条款并保留好还款凭证。