贪污公款是否会被立案，主要取决于贪污的数额和是否存在特定情节。以下是对这一问题的详细解析：
贪污数额标准：
- 数额较大：根据《最高人民法院、最高人民检察院关于办理贪污贿赂刑事案件适用法律若干问题的解释》，贪污数额在三万元以上不满二十万元的，应当立案。这意味着，如果贪污的公款达到或超过这个数额，就满足了立案的基本条件。
- 数额巨大与特别巨大：贪污数额在二十万元以上不满三百万元的，属于“数额巨大”；贪污数额在三百万元以上的，属于“数额特别巨大”。这两种情况同样应当立案，且量刑会更重。
特殊情节标准：
- 即使贪污数额未达到上述标准，但如果存在特定情节，也可能被立案。这些特定情节包括但不限于：贪污救灾、抢险等特定款物；曾因贪污受过党纪、行政处分或刑事追究；赃款赃物用于非法活动；拒不交代赃款赃物去向或拒不配合追缴工作；造成恶劣影响或其他严重后果等。
针对您可能关心的具体数额问题：
- 如果贪污公款数额较小，如5000元，但存在上述特殊情节之一，同样可能被立案。例如，如果这5000元是救灾款物，或者行为人曾因贪污受过处分，那么即使数额不大，也可能面临刑事责任。
法律后果与建议：
- 刑事责任：一旦被立案并认定为贪污罪，将面临严厉的刑事处罚，包括有期徒刑、无期徒刑甚至死刑（在数额特别巨大且造成特别重大损失的情况下），并可能并处罚金或没收财产。
- 建议：如果您或您身边的人涉嫌贪污公款，无论数额大小，都应立即停止违法行为，并尽快向相关部门自首或寻求法律帮助。自首和积极配合调查通常可以在量刑时得到一定的从轻处理。
总结与提醒：
- 贪污公款是严重的违法行为，其立案和量刑标准均受到法律的严格规定。了解并掌握这些标准，对于维护法律秩序和公平正义具有重要意义。
- 如果您有任何关于贪污公款或其他刑事案件的法律问题，都可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。