将刚满十二周岁有不良行为的孩子送特殊矫正学校，在符合法定条件和程序的情况下是合法的。以下从多个角度为你详细分析：

法律依据角度

根据《中华人民共和国预防未成年人犯罪法》相关规定，对于有严重不良行为的未成年人，其父母或者其他监护人、所在学校无力管教或者管教无效的，可以向教育行政部门提出申请，经专门教育指导委员会评估同意后，由教育行政部门决定送入专门学校接受专门教育。这里所称的“专门学校”，在功能上类似于你所说的“特殊矫正学校”，其目的在于对有严重不良行为的未成年人进行教育和矫治，帮助他们纠正不良行为，重新回归正常生活。而“严重不良行为”是指未成年人实施的有刑法规定、因不满法定刑事责任年龄不予刑事处罚的行为，以及严重危害社会的行为，当然也包括一些较为严重的不良行为，具体可由专门教育指导委员会进行评估认定。

程序要求角度

送孩子进入特殊矫正学校并非随意为之，需要遵循严格的程序。首先，要由孩子的父母或者其他监护人、所在学校向教育行政部门提出申请。这一步骤体现了对监护人和学校意见的尊重，毕竟他们是最了解孩子情况的人。其次，专门教育指导委员会要进行评估。专门教育指导委员会通常由教育、心理、法律等多方面的专家组成，他们会从专业的角度对孩子的不良行为、心理状况、家庭环境等进行全面评估，以确定孩子是否适合进入专门学校接受教育。最后，经评估同意后，由教育行政部门作出决定。教育行政部门作为行政机关，会综合考虑各种因素，确保决定的合法性和合理性。只有经过这些法定程序，将孩子送入特殊矫正学校才是合法的。

特殊情况角度

如果孩子的不良行为尚未达到严重不良行为的程度，但已经对自身或他人造成了一定的影响，且父母或其他监护人、学校确实无力管教，也可以考虑通过其他方式进行处理，如加强家庭教育和学校教育的力度，寻求社区、社会组织等的帮助和支持。但如果孩子的不良行为持续发展，有可能演变为严重不良行为，甚至触犯法律，那么及时将其送入特殊矫正学校进行教育和矫治，不仅是对孩子自身的保护，也是对社会公共利益的维护。

法律后果角度

如果未经法定程序，擅自将孩子送入特殊矫正学校，可能会侵犯孩子的合法权益，如受教育权、人身自由权等。孩子或其监护人可以通过法律途径维护自己的权益，如向有关部门投诉、提起行政诉讼等。同时，相关责任人也可能承担相应的法律责任。

建议：如果你面临这样的情况，建议先与孩子进行充分的沟通，了解其不良行为的具体原因和背景。同时，积极与学校、社区等相关方面进行交流，共同探讨解决问题的办法。如果确实需要考虑将孩子送入特殊矫正学校，一定要严格按照法定程序进行操作，确保孩子的合法权益得到保障。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。