在涉及亲子关系确认的诉讼中，若女方拒绝配合进行亲子鉴定，法院会根据现有证据和法律规定进行综合判断，不会直接强制女方进行鉴定，但可能通过推定或证据规则来认定亲子关系是否存在。以下是具体分析：

1. 法院不会直接强制鉴定
   根据《民法典》及相关司法解释，亲子鉴定需以当事人自愿为原则。法院无权强制任何一方（包括女方）接受亲子鉴定，否则可能侵犯其人身权利。因此，若女方明确拒绝，法院不会直接依据“拒绝鉴定”这一行为本身作出对女方不利的判决。

2. 法院可能通过证据规则推定亲子关系
   若男方（原告）能提供初步证据（如血缘关系证明、共同生活记录、证人证言等），证明存在亲子关系的可能性较高，而女方拒绝鉴定且无法提供反证，法院可能根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第95条，推定男方主张的亲子关系成立。
   关键点：男方需承担初步举证责任，证明“存在亲子关系的可能性较大”；女方拒绝鉴定需无合理理由（如健康风险、隐私侵犯等），否则法院可能不采纳推定。

3. 若证据不足，法院可能驳回男方诉求
   若男方无法提供任何初步证据，仅以“怀疑”为由要求确认亲子关系，即使女方拒绝鉴定，法院也可能因证据不足驳回男方诉求。此时，女方拒绝鉴定的行为不会被视为对男方主张的默认。

4. 特殊情形：涉及未成年人权益时
   若案件涉及未成年人抚养、继承等权益，法院可能更谨慎处理。例如，若男方能证明拒绝鉴定可能损害未成年人利益（如无法确定抚养义务人），法院可能通过其他方式（如调查取证、参考其他亲属关系）综合判断，但仍不会直接强制鉴定。

建议：

• 对男方而言，需提前收集血缘关系证明、共同生活记录等证据，提高诉求被支持的可能性；
  
• 对女方而言，若拒绝鉴定需明确合理理由（如健康、隐私），并准备反证（如分居证明、其他亲子关系证据）以应对推定风险。
  

如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合证据规则和司法实践为您详细分析。