结论：破产前以债权抵部分购房款的行为，其合法性需根据具体情况判断，主要涉及债权转让、债务抵销以及破产法相关规定。以下从不同角度详细分析：
一、债权转让角度
债权转让的合法性：
- 根据《民法典》的相关规定，债权人可以将债权的全部或者部分转让给第三人，但有下列情形之一的除外：（一）根据债权性质不得转让；（二）按照当事人约定不得转让；（三）依照法律规定不得转让。
- 若购房款债权不属于上述不得转让的情形，且原债权人与购房者（或开发商）之间有明确的债权转让协议，则该债权转让行为是合法的。
债权转让的通知义务：
- 债权人转让债权，未通知债务人的，该转让对债务人不发生效力。因此，在债权转让后，原债权人应及时通知债务人（即开发商或购房者，视债权转让方向而定），以确保债权转让的效力。
二、债务抵销角度
债务抵销的合法性：
- 根据《民法典》的规定，当事人互负债务，该债务的标的物种类、品质相同的，任何一方可以将自己的债务与对方的到期债务抵销；但是，根据债务性质、按照当事人约定或者依照法律规定不得抵销的除外。
- 若购房者欠开发商购房款，同时开发商又欠购房者其他债务（如租金、违约金等），且双方同意以债权抵销部分购房款，则该行为在符合上述条件下是合法的。
债务抵销的限制：
- 需要注意的是，若购房者或开发商处于破产状态，债务抵销可能受到破产法的限制。根据《企业破产法》的相关规定，债权人在破产申请受理前对债务人负有债务的，可以向管理人主张抵销，但存在特定情形的除外（如债务人的债务人在破产申请受理后取得他人对债务人的债权的）。
三、破产法相关规定
破产申请受理前的债务抵销：
- 在破产申请受理前，若购房者与开发商之间存在债权债务关系，且双方同意以债权抵销部分购房款，该行为通常是被允许的，但需确保债权债务的真实性和合法性。
破产申请受理后的债务处理：
- 若在破产申请受理后，购房者或开发商试图以债权抵销购房款，则可能受到破产法的严格限制。此时，债务抵销需经过管理人的审查，并可能面临被撤销的风险。
四、实际操作建议
签订书面协议：
- 无论以债权转让还是债务抵销的方式处理购房款，双方均应签订书面协议，明确债权债务关系、抵销金额、抵销方式等关键条款，以避免后续纠纷。
及时通知相关方：
- 在债权转让或债务抵销后，应及时通知相关方（如开发商、购房者、管理人等），以确保各方权益得到保障。
咨询专业律师：
- 由于破产法及相关法律规定较为复杂，且涉及多方利益，建议在操作前咨询专业律师，以确保行为的合法性和有效性。
总结：破产前以债权抵部分购房款的行为，在符合债权转让、债务抵销以及破产法相关规定的前提下是合法的。但具体操作时需谨慎，建议签订书面协议、及时通知相关方，并咨询专业律师以规避风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。