工程款起诉后不撤诉，案件将按照法定程序继续推进，最终由法院依法作出判决。具体来说，不撤诉会产生以下法律后果和程序走向：

1. 案件继续审理
   起诉后，法院会依法受理案件并安排开庭审理。若原告不撤诉，法院将根据双方提交的证据、辩论意见及法律规定，对工程款纠纷的实体问题进行审查，包括合同效力、工程验收、结算依据、付款条件等关键事实。

2. 法院可能判决支持或驳回诉求

   • 支持诉求：若原告证据充分（如合同、结算单、催款记录等），法院会判决被告支付工程款及可能的利息、违约金。
     
   • 驳回诉求：若原告证据不足（如未完成验收、结算争议大），或被告提出有效抗辩（如工程质量问题、已超诉讼时效），法院可能驳回全部或部分诉求。

3. 被告需积极应诉，否则可能承担不利后果
   若被告未在法定期限内提交答辩状或出庭应诉，法院可缺席审理并作出判决。此时，被告可能因未行使抗辩权而承担败诉风险，例如被判支付工程款及诉讼费用。

4. 判决生效后进入执行程序
   若原告胜诉且被告未在上诉期内上诉，判决生效后，原告可向法院申请强制执行，包括查封、扣押、拍卖被告财产等措施。若被告仍不履行，可能被列入失信被执行人名单，限制高消费等。

5. 诉讼成本持续产生
   不撤诉意味着诉讼程序继续，双方需承担诉讼费、律师费、鉴定费等实际支出。若案件复杂（如涉及工程审计、质量鉴定），诉讼周期可能延长，成本进一步增加。

建议：

• 若原告证据充分且诉求合理，不撤诉是维护权益的有效途径，但需评估被告履行能力（如财产状况），避免“赢了官司拿不到钱”。
  
• 若双方有和解意愿，可在诉讼中申请调解，法院出具的调解书与判决书具有同等效力，且可缩短纠纷解决时间。
  
• 被告若对工程款有异议，应积极收集反证（如质量不合格报告、已付款凭证等），并在答辩期内提出反诉或抗辩。
  

如有具体案件细节（如合同条款、证据情况等），可进一步向我说明，我会结合实际情况提供更精准的分析。