在网店侵权被起诉的情况下，赔偿方式及数额的确定是一个涉及多方面因素的法律问题。以下是对这一问题的详细解答：
一、赔偿方式
网店侵权，特别是商标侵权，其赔偿方式主要依据《中华人民共和国商标法》的相关规定，通常包括以下几种：
按实际损失赔偿：
- 这是最直接的一种赔偿方式，即依据权利人因被侵权所受到的实际损失来确定赔偿数额。这涵盖了因侵权行为导致的直接经济损失，如商品销售量减少、销售额下降等，同时也包括为制止侵权行为所支付的合理开支，如调查费、取证费、律师费等。
按侵权人获利赔偿：
- 当权利人的实际损失难以确定时，可以按照侵权人因侵权所获得的利益来计算赔偿数额。这通常涉及对侵权商品销售量和单位利润的评估，若单位利润无法查明，则可能参照注册商标商品的单位利润进行计算。
参照许可费倍数赔偿：
- 若权利人的损失或侵权人获得的利益均难以确定，且该商标有许可使用费的标准，那么可以参照此标准的倍数来合理确定赔偿数额。对于恶意侵犯商标专用权且情节严重的，赔偿数额还可能在一倍以上五倍以下进行确定。
法定赔偿：
- 在前述三种方式均无法确定赔偿数额的情况下，由人民法院根据侵权行为的情节判决给予五百万元以下的赔偿。这一规定为法院在处理复杂案件时提供了自由裁量权。
二、赔偿数额的确定因素
在确定赔偿数额时，法院会综合考虑多种因素，以确保判决的公正性和合理性。这些因素包括但不限于：
- 商标的知名度：知名度越高的商标，其受损程度可能越大，因此赔偿数额可能相应增加。
- 侵权行为的持续时间：侵权行为持续的时间越长，对权利人造成的损失可能越大，赔偿数额也可能相应提高。
- 侵权行为的性质：如是否为恶意侵权、是否重复侵权等，这些都会影响赔偿数额的判定。
- 侵权人的主观过错程度：故意侵权与过失侵权的责任承担是有区别的，故意侵权可能会面临更高的赔偿数额。
- 被侵权人为制止侵权行为所支付的合理开支：这部分费用应纳入赔偿范围，以充分保护权利人的合法权益。
三、建议与行动指南
在网店侵权被起诉后，我建议您首先尝试与权利人进行协商，看是否能够达成和解协议，以避免进一步的法律纠纷。如果协商不成，您应及时寻求法律援助，咨询专业律师的意见，并准备相关证据材料以应对可能的诉讼。在诉讼过程中，您应积极配合法院的调查和审理工作，如实陈述事实，提供证据，以便法院能够准确判定赔偿数额。
综上所述，网店侵权被起诉的赔偿方式及数额的确定是一个复杂而细致的过程，需要综合考虑多种因素。通过明确赔偿方式和数额确定的标准及考虑因素，您可以更好地了解自己的法律责任和权益，从而做出合理的应对和决策。