在合同纠纷中，对于标的额五万以下的案件，被告一般不可以直接要求不按照小额诉讼程序进行审理，但存在特定情形下可以提出异议。以下是对这一问题的详细分析：
一、小额诉讼程序的适用条件
小额诉讼程序是民事诉讼法中规定的一种简化程序，旨在快速、高效地解决标的额较小的民事纠纷。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，小额诉讼程序通常适用于事实清楚、权利义务关系明确、争议不大的简单民事案件，且标的额为各省、自治区、直辖市上年度就业人员年平均工资百分之五十以下的案件。对于标的额超过各省、自治区、直辖市上年度就业人员年平均工资百分之五十但在二倍以下的，当事人也可以约定适用小额诉讼的程序。
二、被告对小额诉讼程序的异议权
异议提出的时间：虽然被告不能直接要求不按照小额诉讼程序进行审理，但在案件受理前或审理过程中，如果被告认为案件不符合小额诉讼程序的适用条件，可以向法院提出异议。
异议的理由：被告提出异议的理由通常包括案件事实不清、权利义务关系不明确、争议较大等，或者认为案件标的额超过了小额诉讼程序的适用范围。但需要注意的是，仅仅因为案件标的额较小而提出异议，通常不会被法院采纳。
异议的处理：法院在收到被告的异议后，会进行审查。如果认为异议成立，即案件确实不符合小额诉讼程序的适用条件，法院会裁定将案件转为普通程序进行审理。如果认为异议不成立，法院会驳回异议，继续按照小额诉讼程序进行审理。
三、特定情形下的处理
当事人约定：如果双方当事人在合同中明确约定了不适用小额诉讼程序，或者事后达成一致意见不适用小额诉讼程序，那么法院在审理时会尊重当事人的约定，不按照小额诉讼程序进行审理。
法院依职权决定：在审理过程中，如果法院发现案件虽然标的额较小，但涉及复杂法律关系或需要深入调查取证，认为不适用小额诉讼程序更为合适，也可以依职权决定将案件转为普通程序进行审理。
四、法律建议
了解程序规定：作为被告，在参与诉讼前应充分了解小额诉讼程序的相关规定，包括适用条件、审理方式、救济途径等，以便在诉讼过程中更好地维护自己的权益。
及时提出异议：如果认为案件不符合小额诉讼程序的适用条件，应及时向法院提出异议，并提供相关证据支持自己的观点。
积极配合审理：无论案件是否适用小额诉讼程序，被告都应积极配合法院的审理工作，提供必要的证据和材料，以便法院能够公正、高效地作出裁决。
如果您在合同纠纷中遇到相关问题，或者对小额诉讼程序有进一步的疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。