结论：网贷还完没有申请结清证明，一般情况下不会产生直接的负面影响，但为了确保自身权益和避免潜在纠纷，建议尽量申请结清证明。以下从多个角度进行详细分析：

一、结清证明的作用

结清证明是贷款机构出具给借款人的，证明其已按照合同约定还清全部贷款本息的文件。这份文件对于借款人来说，具有以下几个重要作用：

1. 证明还款事实：结清证明是借款人已还清贷款的直接证据，有助于在需要时证明自己的还款行为。
2. 避免后续纠纷：在贷款还清后，如果贷款机构因系统错误、记录丢失等原因，错误地认为借款人仍有未还款项，结清证明可以作为有力的反驳证据，避免不必要的法律纠纷。
3. 信用记录维护：虽然贷款还清后，借款人的信用记录会逐渐恢复，但结清证明可以作为借款人信用良好的一个额外证明，有助于在未来申请贷款或信用卡时获得更优惠的待遇。

二、未申请结清证明的可能影响

1. 无直接负面影响：在大多数情况下，即使借款人没有申请结清证明，也不会对其产生直接的负面影响。因为贷款机构在借款人还清贷款后，通常会更新其系统记录，反映借款人的还款状态。
2. 潜在风险：然而，如果贷款机构在更新系统记录时出现错误，或者借款人需要证明其还款事实以应对某些特定情况（如申请其他贷款、处理法律纠纷等），没有结清证明可能会给借款人带来一定的麻烦。

三、建议与措施

1. 主动申请结清证明：为了确保自身权益和避免潜在纠纷，建议借款人在还清贷款后，主动向贷款机构申请结清证明。这通常可以通过贷款机构的官方网站、客服热线或线下网点等渠道进行。
2. 保留相关证据：在申请结清证明的同时，借款人也可以保留其他与还款相关的证据，如还款记录、银行流水等，以备不时之需。
3. 及时沟通与处理：如果借款人在还清贷款后，发现贷款机构未更新其系统记录或存在其他问题，应及时与贷款机构沟通并处理，以确保自己的权益不受损害。

总结来说，虽然网贷还完没有申请结清证明在一般情况下不会产生直接的负面影响，但为了确保自身权益和避免潜在纠纷，建议借款人尽量申请结清证明。如果你在网贷还款或结清证明方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。