在审理期间，如果被告人死亡，其主动上缴的违法所得的处理方式会依据具体的法律规定和案件情况来综合判断。以下是对此问题的详细解答：
一、刑事诉讼程序的基本处理原则
首先，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，若犯罪嫌疑人、被告人在审判阶段死亡，人民法院通常会裁定终止审理，因为死亡意味着不再追究其刑事责任。这是刑事诉讼中的一项基本原则。
二、违法所得及涉案财产的特殊处理
然而，对于违法所得及涉案财产的处理，法律有更为细致的规定，特别是针对贪污贿赂犯罪、恐怖活动犯罪等重大犯罪案件：
没收违法所得的申请：
- 如果被告人在审理期间死亡，且存在被认定为违法所得的财产，人民检察院有权向人民法院提出没收违法所得的申请。
法院的审理与裁定：
- 法院在受理申请后，会进行审理，并查证相关财产是否确实属于违法所得或其他涉案财产。
- 如果经查证属实，且不属于依法应返还给被害人的财产，法院会裁定予以没收。
- 如果不属于应当追缴的财产，法院则会裁定驳回申请，并解除对相关财产的查封、扣押、冻结措施。
三、关于您提到的“主动上缴的违法所得”
- 如果被告人在审理期间已经主动上缴了违法所得，这部分财产在性质上仍然属于违法所得，但处理方式会依据上述法律规定进行。
- 具体来说，如果法院最终裁定没收违法所得，那么这部分已经上缴的财产将被依法没收。
- 如果法院裁定驳回没收申请，或者认为这部分财产不属于违法所得，那么可能会根据具体情况决定是否返还给被告人（或其继承人）或其他相关方。
四、民事诉讼与遗产处理的相关性
- 此外，虽然您的问题主要关注刑事诉讼中的违法所得处理，但值得注意的是，在民事诉讼中，如果被告人死亡，其遗产可能需要用来清偿生前的债务。
- 这可能间接影响到违法所得的处理，特别是当违法所得与民事债务存在关联时。然而，在大多数情况下，违法所得的处理主要依据刑事诉讼法的相关规定。
五、总结与建议
- 综上所述，审理期间被告人死亡时，其主动上缴的违法所得将依据刑事诉讼法的相关规定进行处理。
- 如果您或相关方对此有具体疑问或需要进一步的法律帮助，建议咨询专业律师或相关法律机构，以获取更详细和准确的法律意见。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的解释，请随时告诉我。