协商离职时公司是否需要赔偿，主要取决于离职的提出方以及是否存在特殊情况，具体分析如下：
公司提出协商离职：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十六条和第四十六条的规定，若公司主动向员工提出并协商一致解除劳动合同，公司应当向员工支付经济补偿。
- 经济补偿的标准按照员工在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资。这里的月工资是指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
- 计算公式：经济补偿金 = 工作年限 × 月工资（月工资高于当地上年度职工月平均工资三倍的，按三倍计算，且最高不超过十二年）。
员工提出协商离职：
- 一般情况下，如果员工主动向公司提出协商解除劳动合同，公司无需支付经济补偿，这被视为员工自愿离职。
- 但存在特殊情况：如果员工因公司存在过错（如未按时足额支付工资、未提供约定的劳动条件等）而被迫提出协商离职，员工仍有权要求公司支付经济补偿。
特殊情况下的赔偿：
- 公司违法解除：如果公司违反法律法规规定解除或终止劳动合同，根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条，公司需按照经济补偿标准的二倍向员工支付赔偿金。
- 未提前通知：若公司未提前三十日以书面形式通知员工解除劳动合同，还需额外支付一个月工资作为代通知金。
协商离职的注意事项：
- 签订书面协议：无论哪一方提出协商解除劳动合同，双方就赔偿事宜达成一致后，应签订书面的解除劳动合同协议，明确解除时间、经济补偿金额、支付方式及时间等重要条款，以避免后续纠纷。
- 支付时间与手续：公司应在解除或终止劳动合同时出具相关证明，并在十五日内为员工办理档案和社会保险关系转移手续。经济补偿一般应在办结工作交接时支付。
- 争议解决：若双方无法就赔偿事宜达成一致意见，员工可向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或依法向人民法院提起诉讼以维护自己的合法权益。
举例说明：
- 假设员工在公司工作了5年，月工资为10000元，因公司提出协商离职，则公司应支付的经济补偿为5个月工资，即50000元。
- 若员工因公司未按时支付工资而提出协商离职，且工作年限为3年，月工资为8000元，则公司同样应支付3个月工资作为经济补偿，即24000元。
总结与建议：
协商离职时公司是否需要赔偿，需根据具体情况判断。建议双方在协商过程中充分沟通，明确各自的权利和义务，并签订书面协议以确保法律效力。如有任何疑问或争议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供准确的法律意见和帮助。