刑事自诉案件中，被告人未到庭时，通常情况下法院不会进行缺席审理，但在特定条件下可以缺席审判。以下是对此问题的详细分析：

一、通常不允许缺席审理的原则

刑事自诉案件主要涉及侵害公民个人合法权益的轻微刑事案件，这类案件注重当事人的参与和对质。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关规定，法院通常会依法传唤被告人到庭参加诉讼，以保障被告人的辩护权等诉讼权利。若被告人经法庭传唤无正当理由拒不到庭，或者未经法庭许可中途退庭，法院可能会按撤诉处理或采取其他相应措施，如拘传等强制措施强制其到庭，但一般不会直接缺席审理。这是因为缺席审理可能剥夺被告人的辩护权，进而影响司法公正。

二、特殊情形下可缺席审判的规定

尽管一般情况下不允许缺席审理，但在某些特殊情形下，刑事自诉案件是可以缺席审判的。依据2018年修正后的《刑事诉讼法》增设的缺席审判程序，以下情况可以适用缺席审判：

1. 被告人患有严重疾病无法出庭：

   • 如果被告人因患有严重疾病无法出庭，且中止审理超过六个月后仍无法出庭，同时被告人及其法定代理人、近亲属申请或者同意恢复审理的，人民法院可以在被告人不出庭的情况下缺席审理，并依法作出判决。

2. 被告人死亡但有证据证明无罪：

   • 如果被告人已经死亡，人民法院应当裁定终止审理。但是，如果有证据证明被告人无罪，人民法院仍然需要经缺席审理来确认其无罪，并依法作出判决。不过，这种情况在刑事自诉案件中较为罕见。

3. 被告人下落不明且已用尽寻找手段：

   • 在被告人下落不明的情况下，法院通常会裁定中止审理，待被告人到案后恢复审理。但若被告人长期下落不明，且法院已用尽所有可能手段寻找被告人（如公告、传唤等），同时被告人未提出正当理由的，法院也可根据已有证据和情况谨慎作出缺席判决。不过，此种判决必须确保公正合理，避免对被告人的合法权益造成不当侵害。

三、司法实践中的谨慎态度

值得注意的是，尽管存在上述特殊情形下的缺席审判规定，但在司法实践中，对于缺席审判的适用是非常谨慎的。法院会严格依照法律规定的程序和条件进行审查，以确保司法公正和当事人的合法权益不受损害。特别是在刑事自诉案件中，由于案件往往涉及当事人的切身利益，法院更会倾向于保障被告人的出庭权，以确保案件的公正审理。

四、建议与总结

对于刑事自诉案件的被告人未到庭的情况，建议当事人首先了解相关法律规定，明确自己是否处于可以缺席审判的特殊情形下。如果确实存在特殊情形，且希望法院进行缺席审判，应及时向法院提出申请，并提供相关证据支持自己的主张。同时，也需注意，无论何种情况，法院都应确保判决的公正性和合理性。因此，在实际操作中，如果当事人对法律程序或相关规定存在疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律解释和建议。