税务局对自然人有管辖权的主要文件依据如下：

1. 《中华人民共和国税收征收管理法》及其实施细则
   这是税务机关行使税收管辖权的核心法律依据。根据《税收征管法》第四条，法律、行政法规规定负有纳税义务的单位和个人为纳税人，税务机关有权依法对纳税人进行税收征收管理。自然人作为纳税主体（如个人所得税、房产税等纳税人），税务机关对其具有法定管辖权。
   实施细则进一步明确了税务登记、纳税申报、税款征收等具体程序，例如第九条规定“纳税人应当自领取营业执照之日起30日内，持有关证件向税务机关申报办理税务登记”，自然人从事经营活动时需履行登记义务，从而纳入税务管理范围。

2. 《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例
   个人所得税法直接赋予税务机关对自然人收入征税的权力。根据该法第一条，居民个人从中国境内和境外取得的所得，非居民个人从中国境内取得的所得，均需缴纳个人所得税。税务机关通过源泉扣缴（如工资薪金由单位代扣代缴）和自行申报（如综合所得年度汇算）等方式，对自然人纳税义务进行监管。
   实施条例进一步细化了纳税义务发生时间、扣除标准等规则，例如第二十五条规定“取得综合所得需要办理汇算清缴的情形”，明确了自然人需主动配合税务机关完成纳税义务。

3. 《中华人民共和国发票管理办法》及相关规定
   发票管理是税务机关对自然人经济活动实施间接管辖的重要手段。根据《发票管理办法》第十九条，销售商品、提供服务的单位和个人（包括自然人）对外发生经营业务收取款项时，应当向付款方开具发票。税务机关通过发票的开具、取得、保管等环节，监控自然人的经营行为，确保税款不流失。
   例如，自然人临时从事生产经营活动（如摆摊、 freelance 服务）时，若未按规定开具发票，税务机关可依据《税收征管法》第六十四条追究其未申报纳税的责任。

4. 《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》关于税务检查的规定
   税务机关对自然人的管辖权还体现在税务检查权上。根据实施细则第八十五条，税务机关有权到纳税人的生产、经营场所和货物存放地检查应纳税的商品、货物或其他财产，纳税人（包括自然人）有义务接受检查并提供相关资料。
   例如，若自然人名下房产涉及房产税争议，税务机关可依法调取房产登记信息、交易合同等证据，核实纳税义务履行情况。

总结：税务局对自然人的管辖权源于税收法定原则，通过《税收征管法》《个人所得税法》等法律构建了从纳税登记、税款征收到税务检查的完整体系。自然人作为税收法律关系的主体，需依法履行纳税义务，否则将承担补缴税款、滞纳金甚至行政处罚的法律后果。若您遇到具体税务争议（如个税申报、发票合规等），可直接向我咨询，我会结合案情为您详细分析。