私了后是否会有案底，主要取决于案件的性质和具体情况。以下是对这一问题的详细分析：
一、民事案件私了
一般情况：
- 在纯粹的民事纠纷中，如合同纠纷、轻微的侵权纠纷（如轻微的人身伤害、财产损害等），双方当事人可以自行协商解决，即“私了”。此类纠纷主要涉及平等主体之间的人身关系和财产关系，不涉及刑事犯罪，因此私了后通常不会留下案底。
特殊情况：
- 如果在民事纠纷处理过程中，一方当事人的行为涉嫌虚假诉讼等违法行为，并被司法机关认定并追究责任，则可能会留下相应的违法记录。但这并不属于刑事案底，而是民事违法行为记录。
二、刑事案件私了
不构成犯罪的轻微刑事案件：
- 对于情节显著轻微、危害不大的刑事案件，如因民间纠纷引起的轻伤害案件，双方当事人达成和解协议，被害人表示谅解，且案件情节较轻，司法机关可能根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定作出不起诉决定或免予刑事处罚。在此情况下，由于最终未被认定为犯罪，因此不会留下案底。
构成犯罪的刑事案件：
- 对于严重的刑事案件，如故意杀人、强奸、抢劫、绑架等严重暴力犯罪，以及贪污、受贿等职务犯罪，即使双方当事人达成了和解协议，犯罪嫌疑人或被告人也不能因此而免除刑事责任。这些犯罪行为具有严重的社会危害性，必须依法惩处。私了后，犯罪嫌疑人或被告人被定罪判刑，将会留下案底。
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，虽然达成和解协议的案件可以从宽处理，但并不代表不会被追究刑事责任。对于犯罪情节严重的情况，仍应依法惩处。
刑事案件的特殊私了情况：
- 特定类型的刑事案件（如因民间纠纷引起的侵犯财产罪、侵犯公民人身权利罪等）在符合一定条件下，双方当事人可以和解。但这并不意味着私了就完全免除了犯罪嫌疑人的刑事责任，而是一种从宽处理方式。
- 对于达成和解协议的案件，公安机关、人民检察院和人民法院可以根据法律规定提出从宽处理的建议或作出不起诉、从宽处罚的决定。然而，这并不意味着私了就不会留下任何记录。如果案件已经经过公安机关的立案和处理，即使最终未起诉或未判刑，相关记录仍可能保留在公安机关的档案中。
三、实际建议
了解案件性质：
- 在处理案件时，应首先了解案件的性质，判断其是否构成刑事犯罪。这有助于预测私了后是否会留下案底。
咨询专业律师：
- 由于法律问题的复杂性，建议在处理案件时咨询专业律师。律师可以根据案件的具体情况，提供准确的法律意见和指导。
谨慎处理私了协议：
- 如果决定私了，应谨慎处理私了协议。确保协议内容合法、有效，并尽可能保留相关证据，以备不时之需。
总结来说，私了后是否会有案底取决于案件的性质和具体情况。在民事案件中，私了通常不会留下案底；而在刑事案件中，即使双方选择私了，也可能因案件的严重性和公安机关的介入而留下相关记录。因此，在处理案件时，应充分了解案件的性质和法律规定，以做出正确的决策。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。