农村盖房子影响隔壁邻居时，协议是否必须由双方户主签字，这并非一个绝对的要求，而是取决于具体情况及当地政策规定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、一般情况下的法律要求
无需邻居签字的情况：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，农村村民建住宅应符合乡（镇）土地利用总体规划和村庄规划，并由乡（镇）人民政府审核批准。若建房行为完全在自家宅基地范围内，且符合规定的面积、高度、层数等要求，未对邻居造成不利影响，则一般不需要邻居签字即可进行建设。
- 实例说明：村民在自家宅基地内按规划翻建房屋，未超出范围且不影响邻居的通风、采光和日照，这种情况下无需邻居签字。
考虑相邻关系：
- 尽管法律未明确规定盖房需邻居签字，但根据《中华人民共和国民法典》中关于相邻关系的规定，不动产的相邻权利人应遵循有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则处理相邻关系。因此，为避免邻里纠纷，建房前与邻居沟通并解释建房计划是明智之举。
二、特殊情况下的要求
涉及邻里权益时：
- 当建房可能影响到邻居的合法权益，如通风、采光、排水等，或存在侵犯邻居土地权益的潜在问题时，部分地区相关部门为预防后续纠纷，可能会要求建房户取得邻居的签字同意。
- 实例分析：若建房计划中的房屋高度过高或间距过小，可能遮挡邻居的采光，此时需与邻居协商调整方案或取得其书面同意。
地方政策规定：
- 某些地方出于乡村治理、邻里和谐等方面的考量，有特殊规定要求在申请建房审批时需提供邻居的签字同意作为必要条件之一。这种情况下，建房者需遵循当地政策要求。
三、建房流程与注意事项
合法申请建房手续：
- 农村自建房需合法申请办理相关手续，包括宅基地使用权证、乡村规划许可证等。建房者应首先向村委会提出申请，经村委会同意后，再报乡镇建设办公室审批，获得产权证书后方可动工建设。
充分沟通协商：
- 建房前应主动与邻居进行充分沟通，详细解释建房计划，并尽量争取邻居的理解和支持。通过友好协商，往往能够解决大部分因建房引起的相邻关系问题，减少不必要的纠纷。
依法建房并避免纠纷：
- 在确保建房行为符合相关法律法规和规划要求的前提下，即使邻居未签字，建房者也可依法进行建设。但在此过程中，应尽量避免对邻居造成不必要的干扰或损害，以维护良好的邻里关系。
四、法律后果与风险提示
- 若建房行为未经审批或违反规定：可能面临被责令停止建设、限期改正或罚款等行政处罚。若因此引发邻里纠纷，还可能承担民事赔偿责任。
- 若建房行为侵犯邻居权益：邻居有权要求停止侵害、排除妨碍或赔偿损失。在极端情况下，若建房行为构成对邻居土地的非法侵占，还可能涉及刑事责任。
综上所述，农村盖房子影响隔壁邻居时，协议是否必须由双方户主签字取决于多种因素，包括建房行为是否符合规定、是否侵犯邻居权益以及当地政策要求等。建房者在动工前应充分了解相关法律法规和政策规定，并与邻居进行充分沟通协商，以确保建房过程的顺利进行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。