在房屋租赁合同纠纷中，具有管辖权的法院主要包括房屋所在地法院，以及双方在合同中约定的符合法律规定的管辖法院（但不得违反专属管辖原则）。在无专属管辖和有效协议管辖的情况下，则由被告住所地或合同履行地（通常为房屋所在地）法院管辖。以下是具体的法律依据和分析：
一、专属管辖原则
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十三条（现对应条款可能因法律修订而有所调整，但基本原则一致）第一项规定，因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖。房屋租赁合同纠纷作为不动产纠纷的一种，通常由房屋所在地的法院专属管辖。
适用场景：
- 无论合同中是否有管辖约定，只要该约定不违反专属管辖，房屋所在地的法院即具有管辖权。例如，在北京朝阳区有一套房屋，甲将该房屋出租给乙，若双方没有在合同中约定管辖法院，后发生租赁合同纠纷，此时应由北京市朝阳区人民法院管辖，因为朝阳区是房屋所在地，符合专属管辖原则。
二、协议管辖原则（约定管辖）
法律依据：
- 双方可在合同中约定符合法律规定的管辖法院，但需遵守《民事诉讼法》关于协议管辖的规定。具体来说，《中华人民共和国民事诉讼法》第三十五条规定，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。
适用条件：
- 约定的管辖法院必须是与争议有实际联系的地点的人民法院，如合同签订地、合同履行地（通常是房屋所在地）、原告住所地、被告住所地等。
- 约定的管辖法院不得违反级别管辖和专属管辖的规定。例如，即使双方有约定，也不能违背房屋所在地法院的专属管辖权。
三、无专属管辖和有效协议管辖的情况
法律依据：
- 在没有专属管辖和有效协议管辖的情况下，根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，由被告住所地或者合同履行地（对于房屋租赁合同而言，通常就是房屋所在地）人民法院管辖。
适用场景：
- 如果租赁合同未明确约定管辖法院，且案件不涉及不动产的权利确认、分割等专属管辖事项，原告也可以选择向被告住所地或合同履行地（即租赁房屋所在地）的人民法院提起诉讼。但实践中，由于租赁合同纠纷往往与不动产紧密相关，因此更倾向于由不动产所在地法院管辖。
四、诉讼时效
- 一般规定：房屋租赁合同纠纷的法定诉讼时效为三年，自当事人明确知晓或者应当知晓其合法权益受损之日开始计算。
- 特殊情形：涉及“延期支付或拒不支付租金”的问题时，诉讼时效可能调整为一年，从权益开始遭受侵害之日起算起。
总结与建议：
在处理房屋租赁合同纠纷时，应首先确定具有管辖权的法院。通常，房屋所在地的法院具有专属管辖权。如果双方在合同中约定了管辖法院，且该约定符合法律规定且不违反专属管辖原则，则按照约定确定管辖法院。在无专属管辖和有效协议管辖的情况下，则由被告住所地或合同履行地法院管辖。同时，当事人应特别注意诉讼时效的规定，以免因超过时效而丧失维权机会。
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