结论前置：当您已经还清借款但对方未归还欠条时，您应通过保留还款证据、与对方沟通协商、留存辅助证据以及必要时采取法律途径等方法来处理，以确保自身权益不受损害。
一、保留还款证据
电子支付记录：
- 若您通过银行转账、微信、支付宝等电子支付方式还款，务必妥善保存转账记录。这些记录应清晰显示还款时间、金额及收款方信息，是证明还款事实的有力依据。
- 建议截图保存转账记录，并打印带有银行公章的转账明细作为凭证，以备不时之需。
现金还款凭证：
- 若您采用现金方式还款，应要求对方出具收条。收条需明确写明收款金额、还款事由（即偿还哪张欠条对应的欠款）、收款日期，并由收款人签字确认。
- 如有条件，可邀请第三方作为见证人在收条上签字，以增强证明力。
二、与对方沟通协商
直接沟通：
- 尝试与对方进行友好协商，说明款项已还清的事实，并要求对方返还欠条。沟通过程中，可保留电话录音或聊天记录作为佐证，以防后续争议。
书面催告：
- 若直接沟通无果，可通过发送书面催告函的方式正式要求对方返还欠条。催告函应明确说明还款事实、欠条情况以及您的要求，并限定对方在一定期限内给予答复。
- 催告函可通过邮政快递（如EMS）寄出，并在快递单上注明文件内容，同时保留快递底单和查询记录，以证明对方已收到。
三、留存其他辅助证据
聊天记录：
- 保存与对方关于还款事宜的微信、短信等聊天记录。这些记录可作为双方就还款达成共识的佐证，有助于证明您的还款事实。
证人证言：
- 如果还款时有他人在场，如共同朋友、同事等，他们可提供证言证明您已还清了欠款。证人证言在法律上具有一定的证明力，可作为辅助证据使用。
四、法律途径解决
发送律师函：
- 在掌握充分证据后，您可委托我（王明磊律师）向对方发送律师函。律师函将明确指出对方行为的不当之处，并要求其在一定期限内返还欠条或出具债务结清证明，否则将面临法律后果。
提起诉讼：
- 若对方仍不配合，且您担心日后产生纠纷，可向法院提起诉讼。诉讼过程中，您需向法院提交之前保留的各种还款证据和辅助证据，以支持自己的主张。
- 法院将根据证据判断您是否已履行还款义务，并作出相应裁决。如果法院确认您已还清借款，将要求对方返还欠条或出具债务结清证明。
五、特殊情况处理（公证提存）
- 公证提存：若对方故意刁难拒绝配合处理欠条问题，在符合一定条件的情况下，您可考虑向公证机构申请提存还款。提存是将无法交付的标的物交给提存机关保存以消灭债务的制度。但需注意，公证提存需满足一定条件并按照公证机构要求办理，建议您在操作前向我咨询具体流程和要求。
总结：面对还清借款但对方未归还欠条的情况，您应保持冷静和理性，采取适当的措施来保护自己的权益。通过保留还款证据、与对方沟通协商、留存辅助证据以及必要时采取法律途径等方法，您可以有效避免后续纠纷并维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。