在有指纹等相关证据但犯罪嫌疑人不承认的情况下，可以依法对其采取相应的强制措施甚至进行抓捕，但这需要综合考虑多种因素，并确保所有证据均合法、确凿。以下从不同角度进行详细分析：
指纹作为证据的价值与认定
指纹的物证属性：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十条，指纹属于物证的一种，具有客观性和稳定性。在犯罪现场提取到的指纹，若与犯罪嫌疑人的指纹样本经专业鉴定后认定同一，则该指纹是证明犯罪嫌疑人与犯罪现场存在关联的重要证据。
证据的综合判断：
- 单一指纹证据并不能直接决定一个人的罪责，它仅能证明某人在某个时间、地点接触过某物。因此，需要结合其他证据，如目击证人证言、监控录像、现场勘查情况、犯罪嫌疑人的活动轨迹及供述等，来共同构建完整的证据链。这一原则符合《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十五条关于证据确实、充分的规定，即定罪量刑的事实都有证据证明，据以定案的证据均经法定程序查证属实，且综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。
强制措施及抓捕的依据与条件
强制措施的条件：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第八十一条，对有证据证明有犯罪事实，且可能判处徒刑以上刑罚的犯罪嫌疑人，若采取取保候审尚不足以防止发生社会危险性，如可能实施新犯罪、危害公共安全、干扰证人作证、对被害人实施打击报复或企图自杀、逃跑等，应当予以逮捕。
抓捕的合法性：
- 即使指纹等证据指向了某个嫌疑人，也必须经过合法的程序进行调查、取证和审判。这包括了对嫌疑人的合法传唤、讯问及其辩护权利的保障。在任何情况下，都不能违反法定程序对嫌疑人进行抓捕或定罪。
实践中的具体操作与考量
综合证据链条的形成：
- 在司法实践中，侦查机关会结合多种证据进行综合判断，以确保对犯罪嫌疑人的指控达到“证据确实、充分”的标准。这包括但不限于指纹物证、目击证人证言、监控录像资料、犯罪嫌疑人的活动轨迹以及供述等。例如，如果指纹出现在犯罪现场的关键位置，且与其他证据如监控录像显示犯罪嫌疑人出现在现场的时间相吻合，那么这将大大增强指纹作为证据的说服力。
权利保障与程序正义：
- 在整个调查、取证和审判过程中，必须严格遵守法律程序，确保犯罪嫌疑人的合法权益得到保护。这包括传唤的合法性、讯问的公正性以及辩护权利的充分行使等。例如，犯罪嫌疑人有权在讯问时保持沉默，并有权聘请律师为其辩护。
可能的法律后果与建议
如果证据确凿：
- 如果指纹等证据与其他证据形成了完整的证据链，且足以证明犯罪嫌疑人的罪责，那么犯罪嫌疑人可能会被依法逮捕并面临刑事指控。在这种情况下，犯罪嫌疑人应积极配合调查，并考虑聘请律师为其辩护。
如果证据不足：
- 如果仅凭指纹等单一证据无法证明犯罪嫌疑人的罪责，或者证据之间存在矛盾或不合理之处，那么犯罪嫌疑人可能会被释放或取保候审。在这种情况下，犯罪嫌疑人应保留相关证据，并考虑咨询律师以了解其法律权益和可能的辩护策略。
综上所述，虽然指纹等物证在刑事侦查中具有重要意义，但不能仅凭此单一证据就对犯罪嫌疑人进行抓捕或定罪。而是需要综合考虑各种证据和情况，确保每一个判决都是公正、准确且合法的。如果你面临类似的情况或疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更具体的法律建议和帮助。