申请强制执行后仅执行到2000元，该款项的处理方式需结合执行程序的具体阶段和法律规定综合判断，具体如下：

1. 款项的分配与支付
   根据《民事诉讼法》第254条，执行到位的款项应优先支付申请执行人的债权。若2000元为唯一执行到位财产，法院会直接将其划转至申请执行人账户，并出具《执行结案通知书》或《执行情况说明》，明确该款项已用于清偿部分债务。若存在多个债权人，则按《最高人民法院关于适用〈民事诉讼法〉的解释》第508-512条规定的参与分配程序，按债权比例分配。

2. 执行程序的终结与后续救济

   • 终结本次执行程序（终本）：若被执行人无其他可供执行财产（如房产、车辆、存款等），法院会依据《最高人民法院关于严格规范终结本次执行程序的规定（试行）》第1条裁定“终结本次执行程序”，并告知申请执行人可申请恢复执行的条件（如发现新财产线索）。此时，2000元为部分履行，剩余债务仍需继续执行。
     
   • 执行完毕：若2000元已足额清偿债务（如债务总额为2000元），法院会出具《执行结案通知书》，案件彻底终结。

3. 对被执行人的后续措施

   • 财产调查与限制：即使仅执行到2000元，法院仍可依申请执行人申请或职权，对被执行人采取限制高消费、纳入失信被执行人名单等措施（《民事诉讼法》第262条、《最高人民法院关于限制被执行人高消费及有关消费的若干规定》第1条）。
     
   • 继续查找财产：申请执行人可向法院提供被执行人其他财产线索（如工资收入、股权、应收账款等），申请恢复执行。法院也可依职权定期查询被执行人财产状况。

4. 特殊情形处理

   • 执行和解：若双方在执行中达成和解协议（如分期履行），2000元可能为部分履行款。此时需关注和解协议的履行情况，若被执行人未按约履行，可申请恢复原生效法律文书的执行（《民事诉讼法》第237条）。
     
   • 执行异议：若对执行款项的分配、执行程序合法性有异议，可在收到执行通知后10日内向法院提出书面异议（《民事诉讼法》第232条）。

建议行动步骤：

1. 联系执行法院，确认案件状态（是否终本、剩余债务金额）；
   
2. 申请法院出具《执行情况说明》，明确2000元的用途及剩余债务；
   
3. 持续调查被执行人财产线索（如通过律师调查令、公开信息查询等）；
   
4. 若发现被执行人隐匿财产，可向法院申请对其采取罚款、拘留等强制措施（《民事诉讼法》第114条）。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程或法律适用问题。