结论：预付款转为违约金时，是否需要开发票需分情况讨论，主要取决于该款项的性质是否构成增值税应税行为。

1. 若预付款转为违约金属于“价外费用”
   根据《增值税暂行条例》第六条及实施细则第十二条，销售方向购买方收取的违约金、赔偿金等价外费用，应并入销售额计算缴纳增值税。此时，销售方需就该违约金部分开具发票（通常与原货物/服务合并开具或单独开具增值税发票），购买方取得发票后可按规定抵扣进项税额（若符合条件）。
   示例：A公司向B公司支付10万元预付款，后因违约需支付2万元违约金。若该违约金与销售货物相关，B公司需将2万元并入销售额开具发票。

2. 若预付款转为违约金属于“非价外费用”
   若违约金与销售行为无关（如合同未履行且未发生应税行为），则不属于增值税应税范围。此时：

   • 销售方：无需开具发票，但需留存合同、违约证明等资料备查；
     
   • 购买方：若已支付预付款，可要求销售方退还或通过协商处理，但无法取得发票抵扣进项。
     示例：C公司支付5万元预付款后取消订单，双方约定预付款不退还作为违约金。因未发生实际销售，C公司无需发票，但需注意企业所得税前扣除的凭证要求（如法院判决书、双方协议等）。

3. 企业所得税处理提示
   无论是否开具发票，违约金收入均需计入企业所得税应纳税所得额（销售方）或作为损失扣除（购买方），但需提供合法凭证（如发票、法院文书、协议等）。若未取得发票，购买方可能面临税务机关对扣除凭证的质疑。

建议：

• 双方应在合同中明确违约金性质及发票开具条款，避免争议；
  
• 若涉及大额违约金，建议提前咨询税务机关或向我进一步确认具体操作。