在非法集资案件二审中，若犯罪嫌疑人交代幕后老板，司法机关会依法进行调查核实，并根据调查结果采取相应的法律措施，包括但不限于追诉幕后老板的刑事责任、调整案件量刑等。具体处理方式如下：

1. 司法机关的调查核实：

   • 当犯罪嫌疑人在二审中交代幕后老板时，司法机关会立即启动调查程序，对犯罪嫌疑人所提供的信息进行核实。这包括但不限于收集相关证据、询问其他涉案人员、调取银行记录等，以确认幕后老板的身份及其在非法集资活动中的具体作用。

2. 对幕后老板的追诉：

   • 如果调查证实幕后老板确实存在，并且其参与了非法集资活动，司法机关将依法对其提起公诉。幕后老板可能面临的刑事责任包括但不限于非法吸收公众存款罪、集资诈骗罪等，具体罪名和刑罚将根据其犯罪情节和法律规定来确定。

3. 对原犯罪嫌疑人的量刑调整：

   • 犯罪嫌疑人在二审中交代幕后老板，可能被视为立功表现。根据《中华人民共和国刑法》及相关司法解释，立功表现可以作为量刑的酌定情节，对犯罪嫌疑人从轻或减轻处罚。但具体是否从轻或减轻，以及减轻的幅度，需由法院根据案件具体情况和法律规定来综合判断。

4. 案件的整体处理：

   • 非法集资案件往往涉及众多被害人和大量资金，司法机关在处理时会综合考虑案件的社会影响、被害人的利益保护等因素。因此，即使犯罪嫌疑人交代了幕后老板，案件的整体处理仍需遵循法定程序，确保公正、公平、公开。

额外提醒：

• 非法集资案件复杂多变，每个案件的具体情况都有所不同。因此，在处理此类案件时，司法机关会严格依法办事，确保每个涉案人员的合法权益都得到保障。
• 如果您或您身边的人涉及非法集资案件，建议及时咨询专业律师（即向我咨询），了解相关法律规定和案件处理流程，以便更好地维护自己的合法权益。