针对著作权未付尾款且第三方在使用的情况，可分以下两种主要情形处理，核心结论如下：

1. 若著作权许可/转让合同已明确约定尾款支付与使用权限的关联性
   根据《民法典》第527条，若合同约定“未付清尾款则禁止第三方使用”或类似条款，您作为著作权人可立即采取以下措施：

   • 书面催告：向欠款方发送律师函，明确要求其限期支付尾款（通常7-15日），并声明逾期将终止合同并追究违约责任；
     
   • 终止合同：若催告无果，依据《民法典》第563条行使法定解除权，书面通知对方解除合同，并要求赔偿损失（包括已授权第三方的使用费、维权成本等）；
     
   • 起诉第三方：若第三方明知合同未履行完毕仍使用作品，可依据《著作权法》第53条起诉其侵权，要求停止使用、赔偿损失（需证明第三方存在主观过错，如未核实授权链完整性）。
     

2. 若合同未明确约定尾款与使用权限的关联性，或第三方已支付合理对价
   此时需分情况处理：

   • 第三方善意使用：若第三方已向欠款方支付合理对价，且不知情合同未履行完毕，根据《民法典》第311条“善意取得”原则，您可能无法直接起诉第三方，但可：
     
     • 向欠款方追讨尾款，并要求其承担违约责任（如支付违约金、赔偿因第三方使用导致的损失）；
       
     • 若第三方使用行为超出原授权范围（如超出地域、期限、方式等），可依据《著作权法》第53条起诉其侵权。
       
   • 第三方恶意使用：若第三方明知合同未履行完毕仍使用作品（如低价获取授权、与欠款方串通等），您可直接起诉第三方侵权，并要求欠款方承担连带责任（需证明两者存在共同故意）。
     

关键行动建议：

• 固定证据：立即收集合同、授权文件、付款记录、第三方使用证据（如网站截图、宣传材料等），必要时通过公证增强证明力；
  
• 协商优先：尝试与欠款方、第三方协商，明确尾款支付时间与使用限制，避免诉讼成本；
  
• 及时维权：若协商无果，务必在著作权保护期（作者终生及死后50年）内起诉，避免超过诉讼时效（3年，自知道权利受损之日起算）。
  

风险提示：若第三方已通过合法途径获得授权（如从欠款方处合法购买），且您未在合同中明确限制其使用，可能面临维权困难，因此合同条款的严谨性至关重要。

如有具体合同文本或使用场景细节，可进一步向我咨询，我会结合条款内容为您定制解决方案。