有正当理由时，当事人确实可以不出庭，但具体是否允许需根据诉讼类型及实际情况，由法院综合判断后决定。以下从民事诉讼、刑事诉讼及行政诉讼三个角度，详细阐述可以不出庭的正当理由：
民事诉讼中可以不出庭的正当理由
健康原因：
- 被告因重病、伤残或突发重大疾病、意外事件等无法出庭，需提供医疗证明、病历或医院诊断证明等相关证据。
- 例如，被告因车祸导致骨折，无法行走，需提供医院出具的诊断证明和病历，以证明其无法出庭的合理性。
路途遥远与交通不便：
- 被告因距离法院过远或交通条件限制（如自然灾害导致的交通中断）而无法按时到庭，需提供旅行证明、交通延误证明等。
- 例如，被告居住在偏远山区，且遭遇暴雨导致道路中断，无法按时到达法院，需提供当地交通部门或村委会出具的证明。
不可抗力：
- 如地震、洪水、台风等自然灾害导致交通瘫痪、通讯中断，被告需及时与法院联系，并提供当地政府部门发布的灾害预警、受灾情况证明等。
- 例如，被告所在地区遭遇地震，导致房屋倒塌、交通中断，需提供当地政府发布的灾害公告和受灾情况证明。
其他正当理由：
- 包括重要公务或紧急事务（如履行国家公务或处理紧急、重要事务，需提供所在单位出具的证明文件）、被限制人身自由（如因涉嫌犯罪被依法采取刑事拘留、逮捕等强制措施，应提交拘留证、逮捕证等法律文书副本）以及经人民法院认可的其他理由（需具体、合理且符合法律精神）。
刑事诉讼中可以不出庭的正当理由
生理或健康原因：
- 被告患有严重疾病（如癌症晚期、心脏病急性发作等）或精神障碍（需有专业精神病鉴定机构出具的鉴定意见书），导致无法出庭或无法正确表达意志，需提供医院权威诊断证明、病情说明及主治医生意见。
- 例如，被告因心脏病急性发作住院治疗，无法出庭，需提供医院出具的诊断证明和病历。
特殊司法程序或安排：
- 涉及国家安全或重大利益（为保护国家利益和安全，可能根据法律规定对被告出庭作出特殊安排，需提供保密证明和审批文件）或未成年人或特殊群体保护（对于未成年人被告，可能采取不公开审理或特殊庭审方式）。
行政诉讼中可以不出庭的正当理由
原告：
- 因不可抗力或其他不属于自身原因耽误出庭的（如突发公共卫生事件被隔离），可不出庭。同时，原告也可委托诉讼代理人代为出庭。
- 例如，原告因新冠疫情被隔离，无法出庭，需提供当地政府或卫生部门出具的隔离证明。
被告：
- 无正当理由拒不到庭或未经法庭许可中途退庭的，可缺席判决。若因不可抗力等特殊情况无法出庭，应提前向法院说明并申请延期审理。
注意事项与法律后果
- 提前申请与证据提供：被告应尽可能提前向法院说明不出庭的情况，并提供必要的证据材料。
- 法院审查与决定：法院在审查被告的不出庭理由时，将综合考虑各种因素，并作出是否允许的决定。
- 法律后果：若被告无正当理由拒不出庭，将面临法律后果，如人民法院有权采取强制措施强制其到庭，或者给予训诫，情节严重的还可能处以拘留。
总结与建议：在诉讼活动中，若因正当理由无法出庭，当事人应及时向法院说明情况并提供相关证据。法院将综合考虑各种因素，决定是否允许不出庭。为确保自身权益，建议当事人在遇到此类情况时，及时咨询并委托专业律师协助处理。