在商用财产险中，因台风导致房屋灌水，保险公司是否赔偿需分情况讨论，具体如下：

1. 若保险合同明确将台风及其引发的洪水、暴雨等自然灾害列为保障范围
   根据《保险法》第十二条，保险合同是投保人与保险人约定保险权利义务关系的协议。若合同中“保险责任”条款明确包含“台风、暴雨、洪水”等自然灾害导致的财产损失，且房屋灌水直接由台风引发（如强风破坏屋顶/门窗导致雨水灌入，或台风引发暴雨/洪水倒灌），则保险公司应按合同约定赔偿。
   需注意：部分合同可能对“台风”有定义（如风力等级），需结合气象部门证明判断是否符合条款。

2. 若保险合同将台风引发的洪水、暴雨列为除外责任
   若合同“责任免除”条款中明确排除“台风引发的洪水、暴雨导致的损失”，则保险公司可能拒赔。但根据《保险法》第十七条，保险公司需对免责条款履行明确说明义务（如加粗提示、投保人签字确认），否则免责条款可能无效。
   建议：若保险公司拒赔，可要求其提供已履行说明义务的证据，或通过法律途径主张免责条款无效。

3. 若房屋灌水与台风无直接因果关系
   例如：台风未直接破坏房屋，但因排水系统老化导致积水倒灌，此时需判断损失是否由台风“直接引发”。若保险公司能证明损失与台风无直接关联（如排水系统长期未维护），则可能拒赔。
   提示：此类争议需结合现场勘查、气象报告等证据，由专业机构鉴定因果关系。

行动建议：

1. 立即联系保险公司报案，保留现场照片、视频等证据；
   
2. 查阅保险合同“保险责任”和“责任免除”条款，确认是否覆盖台风及洪水；
   
3. 若保险公司拒赔，可要求其出具书面拒赔通知，并咨询律师分析合同条款及证据链，必要时通过诉讼维护权益。
   

如有其他细节需进一步分析（如合同具体条款、损失情况等），可直接向我咨询。