若仲裁条款无效，申请确认其无效应根据案件所处的阶段和具体情况，向仲裁委员会或人民法院提出。以下是详细分析：
一、向仲裁委员会提出申请
适用情形：
- 在仲裁程序开始之前或进行过程中，当事人认为仲裁条款无效时，可以向选定的仲裁委员会提出确认仲裁条款效力的申请。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国仲裁法》第二十条的规定，当事人对仲裁协议的效力有异议的，可以请求仲裁委员会作出决定或者请求人民法院作出裁定。一方请求仲裁委员会作出决定，另一方请求人民法院作出裁定的，由人民法院裁定。
处理流程：
- 仲裁委员会收到申请后，会依据相关法律法规及仲裁规则，对仲裁条款的效力进行审查并作出决定。
二、向人民法院提出申请
适用情形：
- 在仲裁程序开始前，当事人可以直接向人民法院申请确认仲裁条款的效力。
- 在仲裁程序中，如果一方当事人对仲裁条款的效力提出异议，而另一方当事人坚持仲裁，此时也可以直接向人民法院申请确认仲裁条款的效力。
- 仲裁裁决作出后，若当事人以仲裁条款无效为由申请撤销仲裁裁决或不予执行仲裁裁决，也需通过人民法院进行。不过，这种情况更侧重于对仲裁裁决的异议，而非直接对仲裁条款效力的确认，但在实践中，仲裁条款的无效可能是撤销或不予执行仲裁裁决的理由之一。
法律依据：
- 同样依据《中华人民共和国仲裁法》第二十条的规定，以及《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国仲裁法〉若干问题的解释》等相关司法解释。
管辖法院：
- 对于国内仲裁条款，通常由仲裁条款约定的仲裁机构所在地的中级人民法院管辖；仲裁条款约定的仲裁机构不明确的，则由仲裁条款签订地或者被申请人住所地的中级人民法院管辖。
- 对于涉外仲裁条款，则可能由仲裁条款约定的仲裁机构所在地、仲裁条款签订地、申请人或者被申请人住所地的中级人民法院管辖，具体还需根据案件的具体情况和相关法律规定来确定。
法律建议
- 及时提出异议：如果当事人对仲裁条款的效力有异议，应当在仲裁庭首次开庭前提出，以免错过提出异议的时机。
- 准备充分证据：在提出确认仲裁条款无效的申请时，当事人应准备充分的证据来支持自己的主张，如仲裁条款存在瑕疵、违反法律法规强制性规定等。
- 选择合适的申请对象：根据案件所处的阶段和具体情况，选择向仲裁委员会或人民法院提出申请，以确保申请的有效性和及时性。
在处理劳动工伤（劳动仲裁）相关纠纷时，如果涉及仲裁条款无效的问题，建议当事人根据上述分析选择合适的申请对象，并准备充分的证据来支持自己的主张。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。