结论：双方发生事故交警判的三期责任后，即使事后发现对方是非法营运，也并不意味着你就完全不用担责了。责任的划分和承担需要综合考虑多种因素，非法营运只是其中一个可能影响责任认定的情节。
分析：
事故责任认定的基本原则：
- 交通事故责任的认定，主要是依据事故发生时各方的行为对事故发生的作用以及过错的严重程度。交警在判定责任时，会综合考虑车辆行驶状态、交通信号遵守情况、驾驶员操作行为等多方面因素。
- 非法营运，即未经许可擅自从事道路运输经营活动的行为，虽然违反了相关法律法规，但这并不直接决定事故责任的划分。非法营运可能作为加重对方责任的一个情节，但并非决定性因素。
非法营运对事故责任的影响：
- 如果对方确实存在非法营运行为，且该行为与事故发生有直接关联（如因非法营运而超速、疲劳驾驶等），那么在事故责任认定时，可能会考虑这一因素，适当加重对方的责任。
- 然而，如果非法营运行为与事故发生无直接关联，或者你自身也存在过错（如闯红灯、未保持安全距离等），那么你仍需承担相应的责任。
后续处理建议：
- 如果你对交警的责任认定有异议，可以在规定时间内向上级公安机关交通管理部门提出复核申请。
- 在处理事故赔偿时，除了考虑责任划分外，还应关注对方的非法营运行为是否影响了其赔偿能力。如果对方因非法营运而无力赔偿，你可能需要通过法律途径来维护自己的权益。
- 如果对方确实存在非法营运行为，你还可以向相关部门举报，以维护道路运输市场的秩序和安全。
可能后果：
- 如果对方非法营运行为被证实，且该行为与事故有直接关联，那么对方可能会承担更重的责任，但这并不意味着你完全无责。
- 如果对方无力赔偿或逃避赔偿，你可能需要通过诉讼等法律手段来追讨赔偿，这可能会增加你的时间和经济成本。
总结与建议：
- 事故责任的认定是一个复杂的过程，需要综合考虑多种因素。非法营运只是其中一个可能影响责任认定的情节，但并非决定性因素。
- 如果你对责任认定有异议或遇到赔偿问题，建议及时咨询专业律师（即我本人），以便更好地维护自己的权益。
- 在日常生活中，我们也应遵守交通法规，不参与非法营运活动，共同维护道路交通安全和秩序。
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