关于“入职前有不起诉协议，入职后被发现是否有影响”的问题，结论需分情况讨论，具体如下：

1. 不起诉协议的性质与效力
   首先需明确“不起诉协议”的具体内容。若该协议是您与第三方（如前雇主、纠纷对方）签订的民事和解协议，约定双方放弃通过诉讼解决争议的权利，则其本质属于民事合同。根据《民法典》第四百六十五条，依法成立的合同对当事人具有法律约束力，但仅约束协议双方，与新雇主无直接关联。
   例外情形：若协议中涉及您向第三方承诺的特定义务（如保密、竞业限制），且新雇主业务与第三方存在竞争关系，新雇主可能因您违反承诺而主张解除劳动合同或要求赔偿，但此与“不起诉协议”本身无关，而是基于您对第三方的义务。

2. 入职后被发现的可能影响

   • 若协议内容不涉及新雇主利益：新雇主通常无权因您与第三方的协议而主张您违约或解除合同。例如，您与前雇主约定“不起诉工资纠纷”，新雇主无权因此干预。
     
   • 若协议内容涉及新雇主利益：如您与第三方签订的竞业限制协议未到期，新雇主若与第三方存在竞争关系，可能以“您违反竞业限制”为由解除合同或要求赔偿。此时需结合协议具体条款、新雇主业务范围综合判断。
     
   • 隐瞒协议是否构成欺诈：若您在入职时故意隐瞒对履行劳动合同有重大影响的信息（如竞业限制义务），新雇主可能依据《劳动合同法》第二十六条主张合同无效或部分无效，但需证明您隐瞒的信息与劳动合同直接相关且影响其决策。

3. 法律建议

   • 审查协议内容：确认协议是否涉及对第三方的持续义务（如竞业限制、保密），以及义务期限是否覆盖入职新雇主的时间。
     
   • 主动披露风险：若协议可能影响新雇主利益（如竞业限制），建议在入职前主动说明，避免后续纠纷。
     
   • 保留协议证据：若新雇主以此为由主张权利，您需提供协议原件证明其内容及效力范围，必要时可申请司法鉴定。
     

示例：若您与前雇主签订《不起诉协议》，约定“双方放弃就劳动关系争议起诉的权利”，入职新雇主后，新雇主无权因该协议解除合同。但若协议中包含“您离职后2年内不得加入同行企业”的竞业限制条款，且新雇主与前雇主属同行，新雇主可能以此为由主张您违约。

如有具体协议内容或新雇主主张，可进一步向我咨询，我会结合细节为您分析风险及应对方案。