核心结论：酒驾两年后被单位发现，单位可能依据内部规章制度、劳动合同或相关法律法规进行处理，具体处理方式需结合单位性质、规章制度内容及酒驾行为的严重程度等因素综合判断。以下分情况详细说明：
1. 单位依据内部规章制度处理
- 规章制度合法性前提：若单位规章制度中明确规定“员工存在酒驾等违法行为，单位有权解除劳动合同或给予其他处分”，且该制度已通过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会或职工代表协商等）、已向员工公示或告知（如培训签到、制度签收等），则单位可依据该制度对员工进行处理。
- 处理方式：根据制度规定，可能包括警告、记过、降职、降薪、解除劳动合同等。例如，若酒驾未造成严重后果（如未被追究刑事责任），单位可能选择警告或记过；若酒驾被追究刑事责任（如构成危险驾驶罪），单位可能依据《劳动合同法》第39条直接解除劳动合同。
2. 单位依据劳动合同处理
- 劳动合同约定：若劳动合同中明确约定“员工存在酒驾等违法行为，单位有权解除合同”，且该约定不违反法律强制性规定（如不违反《劳动合同法》中关于解除合同的法定情形），则单位可依据合同约定处理。
- 处理限制：若劳动合同未明确约定，单位需谨慎处理。此时，若酒驾行为未被追究刑事责任，单位直接解除合同可能构成违法解除，需支付赔偿金（2N）；若被追究刑事责任，单位可依据《劳动合同法》第39条解除合同，无需支付赔偿。
3. 单位依据法律法规处理
- 刑事责任影响：若酒驾被追究刑事责任（如构成危险驾驶罪，判处拘役、罚金等），单位可依据《劳动合同法》第39条“被依法追究刑事责任的，用人单位可以解除劳动合同”直接解除合同，且无需支付经济补偿或赔偿金。
- 行政处罚影响：若酒驾仅被行政处罚（如暂扣驾驶证、罚款等），未被追究刑事责任，单位需结合内部规章制度处理。此时，若制度未明确规定，单位直接解除合同可能违法，需支付赔偿金。
4. 特殊行业或岗位的额外限制
- 公务员、事业单位人员：若员工为公务员或事业单位人员，酒驾可能违反《公务员法》《事业单位工作人员处分暂行规定》等，单位可依据规定给予警告、记过、降级、撤职、开除等处分。
- 特定职业（如教师、医生）：若员工职业涉及公共安全或道德要求（如教师、医生），酒驾可能违反行业规范或职业道德，单位可依据行业规定或合同约定处理。
建议行动
- 核实单位规章制度：查看单位是否有关于酒驾的处理规定，以及该规定是否合法有效。
- 确认酒驾后果：明确酒驾是否被追究刑事责任（如是否被判刑），或仅受行政处罚。
- 与单位沟通：若单位处理不当（如违法解除合同），可与单位协商或通过劳动仲裁、诉讼维护权益。
- 咨询专业意见：若对处理方式有疑问，可直接向我咨询，我会结合具体情况提供详细法律分析。
总结：酒驾两年后被单位发现，处理方式取决于单位规章制度、劳动合同约定及酒驾行为的严重程度。若单位处理合法合规，员工需接受；若处理违法，员工可通过法律途径维权。如有进一步疑问，欢迎随时向我提问。