购房合同被房屋交易中心拿走，通常属于正常流程，但需根据具体情况判断是否合法合规，并采取相应措施保障自身权益。具体分析如下：

1. 正常流程下的合同留存
   在房屋交易过程中，房屋交易中心（或不动产登记机构）可能因办理过户登记、备案等手续需要留存购房合同原件。例如：

   • 备案要求：部分地区规定购房合同需在交易中心备案，以防止“一房多卖”或保障交易合法性；
     
   • 过户手续：办理房产过户时，交易中心可能需核对合同内容与产权信息，留存原件作为档案。
     若属于此类情况，交易中心通常会在手续完成后出具收件回执或备案证明，购房者可凭此证明合同已被合法留存，无需过度担忧。

2. 非正常流程下的合同留存
   若交易中心无正当理由留存合同（如未告知留存目的、未出具回执、超期留存等），可能涉及程序违规或侵犯权益，需采取以下措施：

   • 要求出具书面证明：立即向交易中心索要留存合同的书面说明（如收件回执、备案凭证），明确留存期限及用途；
     
   • 核对留存必要性：根据当地规定，确认交易中心是否有权留存原件（部分地区仅需复印件备案）；
     
   • 投诉或复议：若交易中心拒绝说明或违规操作，可向其上级主管部门（如住建局、不动产登记局）投诉，或申请行政复议；
     
   • 补充证据：保留合同复印件、付款凭证、沟通记录等，证明交易真实性及自身权益。

3. 合同遗失或损毁的补救措施
   若交易中心因保管不善导致合同遗失或损毁，购房者可：

   • 要求补办合同：与开发商或卖方协商重新签订合同，并共同向交易中心申请补办备案手续；
     
   • 主张赔偿：若因合同遗失导致损失（如无法办理过户、产生额外税费等），可要求交易中心承担赔偿责任（需证明因果关系及损失金额）；
     
   • 公证替代：若无法补办合同，可向公证机构申请对合同复印件进行公证，证明其与原件一致，作为后续维权依据。

建议行动步骤：

1. 立即联系交易中心，确认留存合同的具体原因及期限；
   
2. 要求出具书面回执或备案证明，保留沟通记录；
   
3. 核对当地规定，确认交易中心行为是否合规；
   
4. 若存在违规，及时投诉或申请复议；
   
5. 同步保留合同复印件及其他交易证据，防范风险。
   

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