超过缴纳税款期限后，是否还可以申请行政复议，这主要取决于案件的性质以及是否存在特殊情况。以下是对此问题的详细分析：

1. 选择型案件：

   • 在某些税收争议中，当事人有权在行政复议和行政诉讼之间做出选择。这意味着，如果当事人超过了税收行政复议的申请期限，他们仍然有权依据《行政诉讼法》的规定，在知道或应当知道行政行为之日起六个月内（法律另有规定的除外）向人民法院提起行政诉讼。因此，在选择型案件中，超过缴纳税款期限并不直接剥夺当事人申请行政复议或提起行政诉讼的权利，但需注意诉讼时效。

2. 必经型案件：

   • 根据《税收征收管理法》第八十八条的规定，对于纳税争议，如纳税人、扣缴义务人、纳税担保人与税务机关在纳税上发生争议，必须先依照税务机关的纳税决定缴纳或者解缴税款及滞纳金或者提供相应的担保，然后才能依法申请行政复议。对行政复议决定不服的，才可以依法向人民法院起诉。若当事人超过了税收行政复议的申请期限，则丧失了申请行政复议的权利。由于未经复议程序，他们不能直接向人民法院提起行政诉讼。人民法院可能会以不符合起诉条件为由不予受理或驳回起诉。
   • 但值得注意的是，如果存在不可抗力或其他正当理由导致耽误法定申请期限，申请期限可以自障碍消除之日起继续计算。在这种情况下，当事人仍然有可能申请行政复议，并在对复议决定不服时提起行政诉讼。

3. 一般规定与特殊情形：

   • 通常情况下，如果超过了税收行政复议的时限，并且没有在规定的时间内（如收到复议决定书之日起十五日内或复议期满之日起十五日内）提起行政诉讼，当事人将失去通过诉讼维护权益的机会。
   • 然而，法律总是为特殊情况留有余地。如果存在特殊情况（如不可抗力、正当理由等），可能影响申请期限的计算，进而为当事人保留提起行政诉讼的可能性。

操作建议：

• 在面临税收争议时，首先明确案件的性质（选择型或必经型），并了解相关的法律规定。
• 如果打算提起行政复议或行政诉讼，务必在法定期限内进行，以免丧失法律救济途径。
• 如果存在特殊情况导致耽误期限，及时收集并保留相关证据材料，以便在需要时证明自己的情况。

总结来说，超过缴纳税款期限后是否还可以申请行政复议，取决于案件的性质以及是否存在特殊情况。因此，在实际操作中，建议当事人根据自身情况及时咨询，以便获取准确的法律意见和指导。