结论前置：被告公司与法人地址不一样时，您通常可以选择公司所在地法院起诉，但具体还需根据案件类型和法律规定来确定。以下是对此问题的详细分析：
一、一般原则
在民事诉讼中，一般遵循“原告就被告”的原则，即由被告住所地人民法院管辖。对于公司作为被告的情况，其住所地（即主要办事机构所在地）通常就是公司的注册地或实际经营地。因此，在大多数情况下，您可以选择向被告公司所在地的人民法院提起诉讼。
二、特殊情况下的管辖规定
合同纠纷：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。这意味着，除了被告公司所在地外，您还可以选择向合同履行地的人民法院提起诉讼。
- 举例：如果您与公司签订了一份销售合同，但公司未按约定交付货物，您可以在公司所在地或合同约定的交货地（即合同履行地）的人民法院提起诉讼。
侵权纠纷：
- 对于侵权行为提起的诉讼，由侵权行为地或者被告住所地人民法院管辖。同样，您可以选择向被告公司所在地或侵权行为地的人民法院提起诉讼。
- 举例：如果公司的产品造成了您的人身伤害或财产损失，您可以在公司所在地或侵权行为发生地的人民法院提起诉讼。
其他特殊类型案件：
- 某些特殊类型的案件，如专利纠纷、海事海商纠纷等，可能有特定的管辖规定。这些规定可能涉及专门的法院或特定的地域管辖规则。
- 建议：在涉及这些特殊类型案件时，建议您咨询专业律师以获取更准确的管辖信息。
三、实际操作中的注意事项
确定被告公司所在地：
- 在提起诉讼前，您需要准确确定被告公司的所在地。这通常可以通过查询公司的工商登记信息或实际经营地址来确认。
选择合适的法院：
- 除了考虑被告公司所在地外，您还需要根据案件的具体情况和法律规定，选择合适的法院进行诉讼。例如，如果案件涉及多个被告或多个合同履行地，您可能需要综合考虑各种因素来选择最有利的法院。
遵守级别管辖和专属管辖的规定：
- 在选择起诉地时，您还需要注意遵守级别管辖和专属管辖的规定。级别管辖是指不同级别的法院之间受理第一审民事案件的分工和权限；专属管辖则是指法律强制规定某类案件只能由特定法院管辖。
- 举例：如果案件属于中级人民法院管辖范围（如重大涉外案件、在本辖区有重大影响的案件等），则您不能选择基层人民法院进行诉讼。
四、针对您问题的特别说明
- 既然您提到被告公司与法人地址不一样，这通常不会影响您选择公司所在地法院起诉的权利。因为公司的住所地（即主要办事机构所在地）是确定管辖法院的关键因素，而不是法人的个人地址。
- 建议：在提起诉讼前，建议您先通过工商登记信息或实际经营地址确认公司的住所地，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。
如果您在后续过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。